General Description

        DNA pCR2_1_gal VP

        Entire molecule length: 5842 bp

Restriction Map

Enzyme

# of cuts

Positions

Acc65I

1

241

AciI

66

19 29 85(c) 188(c) 270 502 514 523 535 545 556 602 818 1284 1388 1469(c) 1554 1620(c) 1688 1761(c) 2214(c) 2224(c) 2262(c) 2266 2433 2495(c) 2509(c) 2512(c) 2540 2567 2682 2821(c) 2946 3069(c) 3165 3268 3331 3425(c) 3489(c) 3590(c) 3593(c) 3833 3873(c) 3878 3928(c) 3944 3970 4085(c) 4194(c) 4321(c) 4436(c) 4482 4673(c) 4764(c) 5126 5135(c) 5270 5380(c) 5501(c) 5520(c) 5647(c) 5675(c) 5766 5787 5794 5837(c)

AcsI

5

284 1119 2055 2236 2894

AcyI

3

3111 3359 4290

AflIII

3

1233 2929 5718

AluI

30

56 120 215 237 249 618 662 682 730 874 1168 1883 2020 2411 2626 2665 2883 2980 3033 3059 3105 3465 3923 4477 4540 4640 5161 5418 5554 5780

Alw44I

2

4158 5404

AlwI

21

248(c) 261 1137 1488(c) 1501 2143 3180 3197 3227 3538 3603(c) 3782(c) 3784 4191 4195(c) 4512 4975(c) 4976 5072(c) 5074 5160

AlwNI

3

1770 2983 5309

AosI

3

2461 3461 4607

ApaI

1

2291

ApaLI

2

4158 5404

ApoI

5

284 1119 2055 2236 2894

AseI

5

48 107 2166 2195 4655

AsnI

5

48 107 2166 2195 4655

Asp700

1

4230

Asp718

1

241

AspEI

1

4830

AspHI

9

251 740 1170 1450 3472 3662 4162 4247 5408

AspI

2

1803 3477

AvaI

4

894 1124 1255 2269

AvaII

8

1259 1384 1629 1805 1869 3875 4466 4688

AviII

3

2461 3461 4607

BamHI

2

253 1493

BanI

7

132 241 2672 3110 3358 3393 4877

BanII

6

251 1170 1744 2291 2642 3724

BbsI

2

681(c) 906

BbvI

21

65 649(c) 2029 2401 2474 2543 2898(c) 3306(c) 3432 3474 3490(c) 3583(c) 3995 4396(c) 4787 5090(c) 5296(c) 5299(c) 5389 5808 5826

BcgI

2

1631(c) 4292(c)

BclI

2

1899 3200

BfaI

12

260 825 857 1214 1887 2090 2282 2560 3060 4637 4972 5225

BglI

3

607 2471 4712

BglII

2

654 3195

BmyI

16

251 740 832 1170 1450 1744 2291 2642 3305 3398 3472 3662 3724 4162 4247 5408

BpmI

1

4761

BpuAI

2

681(c) 906

BsaAI

3

2713 2932 3663

BsaBI

5

1224 1904 2250 3194 3218

BsaHI

3

3111 3359 4290

BsaI

4

819 1658(c) 2150 4764

BsaJI

25

137 374 438 561 596 605 1124 1125 1156 1254 1255 1345 1420 1497 1633 1736 1737 1788 1811 2361 2964 3168 3522 3791 5558

BsaWI

8

1381 1542 2923 3092 3390 4534 5365 5512

BsiEI

11

270 1146 1382 2266 2442 2682 3268 4312 4461 5384 5808

BsiHKAI

9

251 740 1170 1450 3472 3662 4162 4247 5408

BsiYI

21

35 562 1261 1262 1400 1401 1421 1674 1724 1725 1756 1814 2213 2494 2820 3340 3884 5240 5519 5685 5703

BslI

21

35 562 1261 1262 1400 1401 1421 1674 1724 1725 1756 1814 2213 2494 2820 3340 3884 5240 5519 5685 5703

BsmAI

8

819 1013(c) 1036(c) 1528(c) 1658(c) 2150 3201(c) 4764

BsmFI

11

356(c) 420(c) 484(c) 1175 1256 1403(c) 1615(c) 1791(c) 1812 2494 3510

BsmI

2

1992 2085(c)

Bsp120I

1

2287

Bsp1286I

16

251 740 832 1170 1450 1744 2291 2642 3305 3398 3472 3662 3724 4162 4247 5408

BspHI

1

4998

BspMI

5

1474 2197 3017(c) 3246(c) 3627

BspWI

35

11 95 139 407 471 522 601 607 714 1564 1770 2240 2271 2295 2441 2471 2504 2506 2548 2575 2605 2911 3050 3350 3434 3457 3596 3602 3719 3755 3802 4712 5100 5672 5786

BsrBI

5

188 2268(c) 2569(c) 3972(c) 5789(c)

BsrDI

3

3592 4596 4770(c)

BsrFI

5

2141 2608 3678 3859 4745

BsrI

24

82 273(c) 539(c) 785 870 1786 2263 2330 2356 2802 2941(c) 2988 3069 3153 3303 3504 4185 4355(c) 4624 4667 4785 5191 5303(c) 5316(c)

BssHII

1

3756

BstNI

11

139 376 440 1157 1738 2181 2363 3746 5559 5572 5693

BstUI

20

31 33 1211 1378 1556 1620 1690 2212 2214 2485 2509 2529 2821 3425 3726 3758 4321 4764 5094 5675

BstXI

2

280 2258

BstYI

15

253 654 1129 1493 2135 3172 3195 3530 3776 4183 4200 4968 4980 5066 5077

CfoI

38

5 33 98 761 1201 1213 1298 1378 1558 2214 2462 2487 2500 2509 2531 2557 2565 2905 3015 3113 3184 3353 3361 3425 3462 3728 3758 3760 3988 4321 4608 4701 5094 5203 5377 5477 5544 5814

Cfr10I

5

2141 2608 3678 3859 4745

Csp6I

4

242 1360 3664 4348

DdeI

7

614 658 1174 4329 4869 5035 5444

DpnI

32

255 656 1131 1227 1495 1901 2137 2441 3174 3191 3197 3202 3221 3532 3610 3691 3700 3778 3789 4149 4185 4202 4460 4506 4524 4865 4970 4982 5060 5068 5079 5154

DpnII

32

253 654 1129 1225 1493 1899 2135 2439 3172 3189 3195 3200 3219 3530 3608 3689 3698 3776 3787 4147 4183 4200 4458 4504 4522 4863 4968 4980 5058 5066 5077 5152

DraI

4

1944 4252 4944 4963

DraII

3

1767 1805 2287

DraIII

1

2716

DrdI

3

2760 3386 5616

DsaI

4

561 1788 1811 3791

DsaV

25

137 374 438 1123 1124 1155 1254 1255 1261 1420 1496 1736 2179 2361 2964 3361 3521 3744 4292 4314 4643 5339 5557 5570 5691

EaeI

11

37 267 1308 2204 2263 2327 3265 3439 3830 3857 4437

EagI

3

267 2263 3265

Eam1105I

1

4830

EarI

8

630(c) 802 1071(c) 2420(c) 3703(c) 3913(c) 4031(c) 5835(c)

Ecl136II

2

249 1168

EclXI

3

267 2263 3265

Eco57I

6

791 996(c) 3505 3937 4164 5176(c)

EcoO109I

3

1767 1805 2287

EcoRI

3

284 1119 2236

EcoRII

11

137 374 438 1155 1736 2179 2361 3744 5557 5570 5691

EcoRV

1

2248

EheI

2

3112 3360

Fnu4HI

42

54 270 602 663 1762 2018 2263 2266 2390 2463 2496 2510 2532 2912 3165 3268 3320 3331 3421 3426 3463 3504 3591 3594 3597 3833 3929 3970 3984 4086 4410 4437 4776 5104 5310 5313 5378 5521 5676 5794 5797 5815

FnuDII

20

31 33 1211 1378 1556 1620 1690 2212 2214 2485 2509 2529 2821 3425 3726 3758 4321 4764 5094 5675

FokI

11

505(c) 1377(c) 2381(c) 2981 3164 3226 3683 3708 4391 4678 4859

FspI

3

2461 3461 4607

HaeII

7

6 1299 2558 2566 3114 3362 5478

HaeIII

29

39 269 595 601 610 1136 1310 1678 1735 1768 1785 2206 2265 2289 2329 2431 2721 2863 3267 3441 3832 3859 4439 4706 4786 5244 5678 5696 5707

HgaI

5

1217 2491 4298 5028(c) 5606(c)

HgiAI

9

251 740 1170 1450 3472 3662 4162 4247 5408

HhaI

38

5 33 98 761 1201 1213 1298 1378 1558 2214 2462 2487 2500 2509 2531 2557 2565 2905 3015 3113 3184 3353 3361 3425 3462 3728 3758 3760 3988 4321 4608 4701 5094 5203 5377 5477 5544 5814

HinP1I

38

3 31 96 759 1199 1211 1296 1376 1556 2212 2460 2485 2498 2507 2529 2555 2563 2903 3013 3111 3182 3351 3359 3423 3460 3726 3756 3758 3986 4319 4606 4699 5092 5201 5375 5475 5542 5812

HincII

4

954 1107 2004 2186

HindII

4

954 1107 2004 2186

HindIII

2

235 1881

HinfI

16

42 848 926 1250 1280 2158 2200 2308 2761 2783 3844 3978 4831 5348 5744 5819

HpaI

3

954 2004 2186

HpaII

31

160 1125 1256 1262 1382 1422 1497 1543 2142 2609 2924 2966 3093 3264 3341 3363 3391 3522 3612 3679 3860 4293 4315 4535 4645 4712 4746 5150 5340 5366 5513

HphI

8

332 1740 2713 4103(c) 4138 4344(c) 4760 4987

ItaI

42

54 270 602 663 1762 2018 2263 2266 2390 2463 2496 2510 2532 2912 3165 3268 3320 3331 3421 3426 3463 3504 3591 3594 3597 3833 3929 3970 3984 4086 4410 4437 4776 5104 5310 5313 5378 5521 5676 5794 5797 5815

KasI

2

3110 3358

KpnI

1

245

Ksp632I

8

630(c) 802 1071(c) 2420(c) 3703(c) 3913(c) 4031(c) 5835(c)

MaeI

12

260 825 857 1214 1887 2090 2282 2560 3060 4637 4972 5225

MaeII

13

1188 1753 2343 2602 2712 2755 2767 2931 3475 3662 4228 4601 5017

MaeIII

18

262 320 994 1085 2029 2347 2367 2523 2535 3479 4169 4357 4510 4568 4899 5182 5298 5361

MamI

5

1224 1904 2250 3194 3218

MboI

32

253 654 1129 1225 1493 1899 2135 2439 3172 3189 3195 3200 3219 3530 3608 3689 3698 3776 3787 4147 4183 4200 4458 4504 4522 4863 4968 4980 5058 5066 5077 5152

MboII

18

10 647 681(c) 784 789(c) 911 1088 1687(c) 2437 2574(c) 3720 3930 4010(c) 4048 4157 4235 4990 5061(c)

McrI

11

270 1146 1382 2266 2442 2682 3268 4312 4461 5384 5808

MfeI

1

1991

MluNI

1

3441

MnlI

34

32 585(c) 591(c) 615 621 631(c) 643(c) 676 903 1041 1177(c) 1422 1505(c) 1922(c) 1961 1969 2214(c) 2278(c) 2421(c) 2686 3125 3210(c) 3274(c) 3410(c) 3767(c) 3960 4457(c) 4663(c) 4810 4891 5291 5541(c) 5615 5824(c)

MscI

1

3441

MseI

22

48 107 723 953 1943 2003 2166 2185 2195 2378 2503 2774 2872 2889 4251 4616 4655 4890 4943 4957 4962 5014

MslI

4

3796 4059 4418 4577

MspA1I

8

56 820 2411 3105 3465 4194 5135 5380

MspI

31

160 1125 1256 1262 1382 1422 1497 1543 2142 2609 2924 2966 3093 3264 3341 3363 3391 3522 3612 3679 3860 4293 4315 4535 4645 4712 4746 5150 5340 5366 5513

MunI

1

1991

MvaI

11

139 376 440 1157 1738 2181 2363 3746 5559 5572 5693

MvnI

20

31 33 1211 1378 1556 1620 1690 2212 2214 2485 2509 2529 2821 3425 3726 3758 4321 4764 5094 5675

MwoI

35

11 95 139 407 471 522 601 607 714 1564 1770 2240 2271 2295 2441 2471 2504 2506 2548 2575 2605 2911 3050 3350 3434 3457 3596 3602 3719 3755 3802 4712 5100 5672 5786

NaeI

2

2610 3861

NarI

2

3111 3359

NciI

14

1125 1126 1256 1257 1263 1422 1498 2966 3363 3523 4294 4316 4645 5341

NcoI

3

561 1811 3791

NdeII

32

253 654 1129 1225 1493 1899 2135 2439 3172 3189 3195 3200 3219 3530 3608 3689 3698 3776 3787 4147 4183 4200 4458 4504 4522 4863 4968 4980 5058 5066 5077 5152

NgoMI

2

2608 3859

NlaIII

23

226 410 474 565 708 913 1205 1237 1815 2131 2278 3052 3233 3578 3764 3795 3821 4387 4423 4501 4511 5002 5722

NlaIV

29

134 243 255 380 444 1137 1260 1386 1495 1551 1631 1677 1786 1806 1807 2289 2641 2653 2674 2922 3112 3360 3395 4533 4744 4785 4879 5651 5690

NotI

1

2263

NsiI

3

412 476 2280

NspI

8

410 474 708 1205 1237 2278 3764 5722

PaeR7I

2

894 2269

PleI

8

1274(c) 2166 2316 2769 2777(c) 4839 5342(c) 5827

Ppu10I

3

408 472 2276

PpuMI

1

1805

Psh A1

1

1148

Psp1406I

2

4228 4601

PstI

2

2245 3412

PvuI

2

2442 4461

PvuII

4

56 2411 3105 3465

RcaI

1

4998

RsaI

4

243 1361 3665 4349

RsrII

1

3875

SacI

2

251 1170

SapI

3

3703(c) 3913(c) 5835(c)

Sau3AI

32

253 654 1129 1225 1493 1899 2135 2439 3172 3189 3195 3200 3219 3530 3608 3689 3698 3776 3787 4147 4183 4200 4458 4504 4522 4863 4968 4980 5058 5066 5077 5152

Sau96I

19

1135 1259 1384 1629 1676 1734 1767 1784 1805 1869 2287 2288 2430 2719 3875 4466 4688 4705 4784

ScaI

1

4349

ScrFI

25

139 376 440 1125 1126 1157 1256 1257 1263 1422 1498 1738 2181 2363 2966 3363 3523 3746 4294 4316 4645 5341 5559 5572 5693

SfaNI

17

419 483 979(c) 1330(c) 1399 2057 2287 3317(c) 3572(c) 3658 3722 3788(c) 3997 4129(c) 4378 4569(c) 5621(c)

SfcI

10

327 1924 2151 2241 2301 2490 3408 4584 5262 5453

SfiI

1

607

SmaI

2

1126 1257

SnoI

2

4158 5404

SpeI

1

259

SphI

6

410 474 708 1205 2278 3764

StyI

6

561 1345 1633 1811 3168 3791

TaqI

14

336 696 895 1224 1317 1651 2270 2678 3472 3628 3652 3688 4176 5620

TfiI

8

42 848 926 1250 2200 3844 3978 5744

ThaI

20

31 33 1211 1378 1556 1620 1690 2212 2214 2485 2509 2529 2821 3425 3726 3758 4321 4764 5094 5675

Tru9I

22

48 107 723 953 1943 2003 2166 2185 2195 2378 2503 2774 2872 2889 4251 4616 4655 4890 4943 4957 4962 5014

Tsp509I

21

104 179 196 284 416 480 572 1119 1350 1991 2055 2167 2236 2292 2319 2894 3096 4024 4397 4652 4958

Tth111I

2

1803 3477

XbaI

2

1886 2281

XcmI

2

1786 3175

XhoI

2

894 2269

XhoII

15

253 654 1129 1493 2135 3172 3195 3530 3776 4183 4200 4968 4980 5066 5077

XmaI

2

1124 1255

XmaIII

3

267 2263 3265

XmnI

1

4230

cspI

1

3875

 

        No cuts: AatI, AatII, AccI, AccIII, AflII, AgeI, AscI, AsuII, AvrII, BbrPI, BfrI, BlnI, Bpu1102I, BseAI, BsgI, BsiWI, BsmBI, BspDI, BspEI, BsrGI, Bst1107I, BstBI, BstEII, Bsu36I, CelII, ClaI, Csp45I, Eco47III, EcoNI, Esp3I, EspI, Fse I, FseI, KspI, MluI, MroI, NdeI, NheI, NruI, NspV, PacI, PflMI, PinAI, PmaCI, PmeI, PmlI, SacII, SalI, SexAI, SfuI, SgrAI, SnaBI, SrfI, SspBI, SspI, StuI, SwaI, Van91I