General Description

        DNA pCR2_1 VPCP

        Entire molecule length: 5504 bp

Restriction Map

Enzyme

# of cuts

Positions

Acc65I

1

241

AciI

61

19 29 85(c) 188(c) 270 298 308 1223 1332(c) 1515(c) 1582(c) 1628(c) 1639(c) 1649(c) 1661(c) 1670(c) 1682(c) 1924(c) 1928 2095 2157(c) 2171(c) 2174(c) 2202 2229 2344 2483(c) 2608 2731(c) 2827 2930 2993 3087(c) 3151(c) 3252(c) 3255(c) 3495 3535(c) 3540 3590(c) 3606 3632 3747(c) 3856(c) 3983(c) 4098(c) 4144 4335(c) 4426(c) 4788 4797(c) 4932 5042(c) 5163(c) 5182(c) 5309(c) 5337(c) 5428 5449 5456 5499(c)

AcsI

5

284 465 1244 1898 2556

AcyI

3

2773 3021 3952

AflIII

3

1381 2591 5380

AluI

29

56 120 215 237 249 504 929 1017 1068 1450 1524 1568 2073 2288 2327 2545 2642 2695 2721 2767 3127 3585 4139 4202 4302 4823 5080 5216 5442

Alw44I

2

3820 5066

AlwI

20

248(c) 261 380(c) 1213(c) 1226 2842 2859 2889 3200 3265(c) 3444(c) 3446 3853 3857(c) 4174 4637(c) 4638 4734(c) 4736 4822

AlwNI

2

2645 4971

AosI

3

2123 3123 4269

ApaI

2

1507 1953

ApaLI

2

3820 5066

ApoI

5

284 465 1244 1898 2556

AseI

5

48 107 327 356 4317

AsnI

5

48 107 327 356 4317

Asp700

1

3892

Asp718

1

241

AspEI

1

4492

AspHI

8

251 866 931 3134 3324 3824 3909 5070

AspI

1

3139

AvaI

2

1359 1931

AvaII

4

1356 3537 4128 4350

AviII

3

2123 3123 4269

BamHI

2

253 1218

BanI

9

132 241 752 941 2334 2772 3020 3055 4539

BanII

6

251 931 1507 1953 2304 3386

BbvI

21

65 491(c) 797(c) 2063 2136 2205 2560(c) 2968(c) 3094 3136 3152(c) 3245(c) 3657 4058(c) 4449 4752(c) 4958(c) 4961(c) 5051 5470 5488

BcgI

1

3954(c)

BclI

2

622 2862

BfaI

15

260 432 636 709 889 1014 1018 1402 1521 1944 2222 2722 4299 4634 4887

BglI

3

1582 2133 4374

BglII

2

1528 2857

BmyI

15

251 755 866 931 1507 1953 2304 2967 3060 3134 3324 3386 3824 3909 5070

BpmI

1

4423

BsaAI

3

2375 2594 3325

BsaBI

5

621 1394 1912 2856 2880

BsaHI

3

2773 3021 3952

BsaI

2

370(c) 4426

BsaJI

22

137 759 1123 1140 1191 1226 1269 1359 1360 1458 1507 1577 1586 1621 1744 1808 2023 2626 2830 3184 3453 5220

BsaWI

6

2585 2754 3052 4196 5027 5174

BsgI

1

1079(c)

BsiEI

10

270 1474 1928 2104 2344 2930 3974 4123 5046 5470

BsiHKAI

8

251 866 931 3134 3324 3824 3909 5070

BsiYI

14

35 314 994 1359 1360 1627 2156 2482 3002 3546 4902 5181 5347 5365

BslI

14

35 314 994 1359 1360 1627 2156 2482 3002 3546 4902 5181 5347 5365

BsmAI

3

370(c) 2863(c) 4426

BsmFI

7

1358(c) 1439(c) 1698 1762 1826 2156 3172

BsmI

2

441 534(c)

Bsp120I

2

1503 1949

Bsp1286I

15

251 755 866 931 1507 1953 2304 2967 3060 3134 3324 3386 3824 3909 5070

BspHI

1

4660

BspMI

4

323(c) 2679(c) 2908(c) 3289

BspWI

34

11 95 139 963 1521 1582 1588 1667 1718 1782 1902 1933 1957 2103 2133 2166 2168 2210 2237 2267 2573 2712 3012 3096 3119 3258 3264 3381 3417 3464 4374 4762 5334 5448

BsrBI

5

188 1930(c) 2231(c) 3634(c) 5451(c)

BsrDI

3

3254 4258 4432(c)

BsrFI

5

379 2270 3340 3521 4407

BsrI

23

82 273(c) 728(c) 1075(c) 1649 1925 1992 2018 2464 2603(c) 2650 2731 2815 2965 3166 3847 4017(c) 4286 4329 4447 4853 4965(c) 4978(c)

BssHII

1

3418

BstNI

13

139 342 760 1028 1192 1460 1745 1809 2025 3408 5221 5234 5355

BstUI

16

31 33 310 312 1407 2147 2171 2191 2483 3087 3388 3420 3983 4426 4756 5337

BstXI

2

280 1920

BstYI

14

253 385 1218 1528 2834 2857 3192 3438 3845 3862 4630 4642 4728 4739

CfoI

36

5 33 98 312 1322 1407 1419 1520 2124 2149 2162 2171 2193 2219 2227 2567 2677 2775 2846 3015 3023 3087 3124 3390 3420 3422 3650 3983 4270 4363 4756 4865 5039 5139 5206 5476

Cfr10I

5

379 2270 3340 3521 4407

Csp6I

7

242 701 920 1156 1256 3326 4010

DdeI

9

909 925 971 1525 1569 3991 4531 4697 5106

DpnI

31

255 387 624 1220 1391 1530 2103 2836 2853 2859 2864 2883 3194 3272 3353 3362 3440 3451 3811 3847 3864 4122 4168 4186 4527 4632 4644 4722 4730 4741 4816

DpnII

31

253 385 622 1218 1389 1528 2101 2834 2851 2857 2862 2881 3192 3270 3351 3360 3438 3449 3809 3845 3862 4120 4166 4184 4525 4630 4642 4720 4728 4739 4814

DraI

4

581 3914 4606 4625

DraII

3

763 1503 1949

DraIII

3

912 998 2378

DrdI

3

2422 3048 5278

DsaI

6

1123 1140 1226 1507 1621 3453

DsaV

24

137 340 758 994 1026 1190 1352 1358 1359 1458 1743 1807 2023 2626 3023 3183 3406 3954 3976 4305 5001 5219 5232 5353

EaeI

11

37 267 316 1306 1925 1989 2927 3101 3492 3519 4099

EagI

3

267 1925 2927

Eam1105I

1

4492

EarI

6

1553 2082(c) 3365(c) 3575(c) 3693(c) 5497(c)

Ecl136II

2

249 929

EclXI

3

267 1925 2927

Eco57I

4

3167 3599 3826 4838(c)

EcoO109I

3

763 1503 1949

EcoRI

3

284 1244 1898

EcoRII

13

137 340 758 1026 1190 1458 1743 1807 2023 3406 5219 5232 5353

EcoRV

2

694 1910

EheI

2

2774 3022

Fnu4HI

42

54 270 505 811 1516 1583 1925 1928 2052 2125 2158 2172 2194 2574 2827 2930 2982 2993 3083 3088 3125 3166 3253 3256 3259 3495 3591 3632 3646 3748 4072 4099 4438 4766 4972 4975 5040 5183 5338 5456 5459 5477

FnuDII

16

31 33 310 312 1407 2147 2171 2191 2483 3087 3388 3420 3983 4426 4756 5337

FokI

13

711(c) 782(c) 1010(c) 1677 2043(c) 2643 2826 2888 3345 3370 4053 4340 4521

FspI

3

2123 3123 4269

HaeII

8

6 1323 1521 2220 2228 2776 3024 5140

HaeIII

31

39 269 318 656 765 823 1022 1139 1145 1308 1505 1576 1585 1591 1927 1951 1991 2093 2383 2525 2929 3103 3494 3521 4101 4368 4448 4906 5340 5358 5369

HgaI

5

1396(c) 2153 3960 4690(c) 5268(c)

HgiAI

8

251 866 931 3134 3324 3824 3909 5070

HhaI

36

5 33 98 312 1322 1407 1419 1520 2124 2149 2162 2171 2193 2219 2227 2567 2677 2775 2846 3015 3023 3087 3124 3390 3420 3422 3650 3983 4270 4363 4756 4865 5039 5139 5206 5476

HinP1I

36

3 31 96 310 1320 1405 1417 1518 2122 2147 2160 2169 2191 2217 2225 2565 2675 2773 2844 3013 3021 3085 3122 3388 3418 3420 3648 3981 4268 4361 4754 4863 5037 5137 5204 5474

HincII

2

338 520

HindII

2

338 520

HindIII

1

235

HinfI

16

42 321 363 740 792 1335 1365 1970 2423 2445 3506 3640 4493 5010 5406 5481

HpaI

2

338 520

HpaII

27

160 380 995 1354 1360 2271 2586 2628 2755 2926 3003 3025 3053 3184 3274 3341 3522 3955 3977 4197 4307 4374 4408 4812 5002 5028 5175

HphI

10

688(c) 773(c) 778(c) 1855(c) 2375 3765(c) 3800 4006(c) 4422 4649

ItaI

42

54 270 505 811 1516 1583 1925 1928 2052 2125 2158 2172 2194 2574 2827 2930 2982 2993 3083 3088 3125 3166 3253 3256 3259 3495 3591 3632 3646 3748 4072 4099 4438 4766 4972 4975 5040 5183 5338 5456 5459 5477

KasI

2

2772 3020

KpnI

1

245

Ksp632I

6

1553 2082(c) 3365(c) 3575(c) 3693(c) 5497(c)

MaeI

15

260 432 636 709 889 1014 1018 1402 1521 1944 2222 2722 4299 4634 4887

MaeII

12

1428 2005 2264 2374 2417 2429 2593 3137 3324 3890 4263 4679

MaeIII

18

262 490 737 904 1861 2009 2029 2185 2197 3141 3831 4019 4172 4230 4561 4844 4960 5023

MamI

5

621 1394 1912 2856 2880

MboI

31

253 385 622 1218 1389 1528 2101 2834 2851 2857 2862 2881 3192 3270 3351 3360 3438 3449 3809 3845 3862 4120 4166 4184 4525 4630 4642 4720 4728 4739 4814

MboII

14

10 652(c) 1110(c) 1540(c) 2099 2236(c) 3382 3592 3672(c) 3710 3819 3897 4652 4723(c)

McrI

10

270 1474 1928 2104 2344 2930 3974 4123 5046 5470

MfeI

1

529

MluNI

1

3103

MnlI

35

32 311 556(c) 565(c) 605 674 794 879 932(c) 955 966(c) 1442 1544 1556 1566(c) 1572(c) 1596 1602 1940(c) 2083(c) 2348 2787 2872(c) 2936(c) 3072(c) 3429(c) 3622 4119(c) 4325(c) 4472 4553 4953 5203(c) 5277 5486(c)

MscI

1

3103

MseI

25

48 107 327 337 356 519 580 715 855 882 1185 1441 2040 2165 2436 2534 2551 3913 4278 4317 4552 4605 4619 4624 4676

MslI

4

3458 3721 4080 4239

MspA1I

7

56 2073 2767 3127 3856 4797 5042

MspI

27

160 380 995 1354 1360 2271 2586 2628 2755 2926 3003 3025 3053 3184 3274 3341 3522 3955 3977 4197 4307 4374 4408 4812 5002 5028 5175

MunI

1

529

MvaI

13

139 342 760 1028 1192 1460 1745 1809 2025 3408 5221 5234 5355

MvnI

16

31 33 310 312 1407 2147 2171 2191 2483 3087 3388 3420 3983 4426 4756 5337

MwoI

34

11 95 139 963 1521 1582 1588 1667 1718 1782 1902 1933 1957 2103 2133 2166 2168 2210 2237 2267 2573 2712 3012 3096 3119 3258 3264 3381 3417 3464 4374 4762 5334 5448

NaeI

2

2272 3523

NarI

2

2773 3021

NciI

11

996 1354 1360 1361 2628 3025 3185 3956 3978 4307 5003

NcoI

5

1140 1226 1507 1621 3453

NdeII

31

253 385 622 1218 1389 1528 2101 2834 2851 2857 2862 2881 3192 3270 3351 3360 3438 3449 3809 3845 3862 4120 4166 4184 4525 4630 4642 4720 4728 4739 4814

NgoMI

2

2270 3521

NheI

1

1520

NlaIII

27

226 397 839 1144 1156 1174 1230 1244 1385 1417 1511 1625 1716 1780 1940 2714 2895 3240 3426 3457 3483 4049 4085 4163 4173 4664 5384

NlaIV

27

134 243 255 655 754 764 943 1146 1220 1358 1505 1742 1806 1951 2303 2315 2336 2584 2774 3022 3057 4195 4406 4447 4541 5313 5352

NotI

1

1925

NsiI

3

1714 1778 1942

NspI

7

1385 1417 1716 1780 1940 3426 5384

PaeR7I

1

1931

PleI

10

357(c) 734(c) 786(c) 1343 1978 2431 2439(c) 4501 5004(c) 5489

Ppu10I

3

1710 1774 1938

Psh A1

1

1470

Psp1406I

2

3890 4263

PstI

3

815 1907 3074

PvuI

2

2104 4123

PvuII

4

56 2073 2767 3127

RcaI

1

4660

RsaI

7

243 702 921 1157 1257 3327 4011

RsrII

1

3537

SacI

2

251 931

SapI

3

3365(c) 3575(c) 5497(c)

Sau3AI

31

253 385 622 1218 1389 1528 2101 2834 2851 2857 2862 2881 3192 3270 3351 3360 3438 3449 3809 3845 3862 4120 4166 4184 4525 4630 4642 4720 4728 4739 4814

Sau96I

16

654 763 822 1144 1356 1503 1504 1949 1950 2092 2381 3537 4128 4350 4367 4446

ScaI

1

4011

ScrFI

24

139 342 760 996 1028 1192 1354 1360 1361 1460 1745 1809 2025 2628 3025 3185 3408 3956 3978 4307 5003 5221 5234 5355

SfaNI

17

463(c) 733 966 1284 1699(c) 1763(c) 1949 2979(c) 3234(c) 3320 3384 3450(c) 3659 3791(c) 4040 4231(c) 5283(c)

SfcI

11

369 598 811 1855 1903 1963 2152 3070 4246 4924 5115

SfiI

1

1582

SmaI

1

1361

SnoI

2

3820 5066

SpeI

1

259

SphI

5

1417 1716 1780 1940 3426

StyI

7

1140 1226 1269 1507 1621 2830 3453

TaqI

13

350 1206 1299 1392 1848 1932 2340 3134 3290 3314 3350 3838 5282

TfiI

6

42 321 1365 3506 3640 5406

ThaI

16

31 33 310 312 1407 2147 2171 2191 2483 3087 3388 3420 3983 4426 4756 5337

Tru9I

25

48 107 327 337 356 519 580 715 855 882 1185 1441 2040 2165 2436 2534 2551 3913 4278 4317 4552 4605 4619 4624 4676

Tsp509I

22

104 179 196 284 353 465 529 712 1244 1264 1610 1702 1766 1898 1954 1981 2556 2758 3686 4059 4314 4620

Tth111I

1

3139

XbaI

2

635 1943

XcmI

1

2837

XhoI

1

1931

XhoII

14

253 385 1218 1528 2834 2857 3192 3438 3845 3862 4630 4642 4728 4739

XmaI

1

1359

XmaIII

3

267 1925 2927

XmnI

1

3892

cspI

1

3537

 

        No cuts: AatI, AatII, AccI, AccIII, AflII, AgeI, AscI, AsuII, AvrII, BbrPI, BbsI, BfrI, BlnI, Bpu1102I, BpuAI, BseAI, BsiWI, BsmBI, BspDI, BspEI, BsrGI, Bst1107I, BstBI, BstEII, Bsu36I, CelII, ClaI, Csp45I, Eco47III, EcoNI, Esp3I, EspI, Fse I, FseI, KspI, MluI, MroI, NdeI, NruI, NspV, PacI, PflMI, PinAI, PmaCI, PmeI, PmlI, PpuMI, SacII, SalI, SexAI, SfuI, SgrAI, SnaBI, SrfI, SspBI, SspI, StuI, SwaI, Van91I