(Linear) (Circular) MAPSORT of: prep8cat.seq check: 2327 from: 1 to: 12341 With 203 enzymes: * February 23, 1996 15:01 .. AatII G_ACGT'C Cuts at: 7359 7359 Size: 12341 AccI GT'mk_AC Cuts at: 8 1614 9850 8 Size: 1606 8236 2499 Fragments arranged by size: 8236 2499 1606 AceIII CAGCTCnnnnnnn'nnnn_ Cuts at: 104 879 1830 4983 6736 9966 11730 104 Size: 775 951 3153 1753 3230 1764 715 Fragments arranged by size: 3230 3153 1764 1753 951 775 715 AciI C'CG_C Cuts at: 36 46 85 460 554 918 1133 1137 1250 Size: 10 39 375 94 364 215 4 113 Cuts at: 1250 1485 1503 2239 3330 3346 3349 3378 3388 Size: 235 18 736 1091 16 3 29 10 Cuts at: 3388 3430 3510 3690 3697 3703 3712 3730 3736 Size: 42 80 180 7 6 9 18 6 Cuts at: 3736 3746 3846 3898 4008 4026 4066 4093 4096 Size: 10 100 52 110 18 40 27 3 Cuts at: 4096 4126 4171 4182 4267 4281 4314 4356 4359 Size: 30 45 11 85 14 33 42 3 Cuts at: 4359 4443 4500 4665 4712 4723 4733 4745 4754 Size: 84 57 165 47 11 10 12 9 Cuts at: 4754 4766 5004 5043 5053 5095 5162 5177 5245 Size: 12 238 39 10 42 67 15 68 Cuts at: 5245 5278 5303 5348 5372 5384 5426 5480 5533 Size: 33 25 45 24 12 42 54 53 Cuts at: 5533 5549 5555 5589 5617 5744 5763 5884 5994 Size: 16 6 34 28 127 19 121 110 Cuts at: 5994 6129 6138 6500 6591 6782 6828 6949 6993 Size: 135 9 362 91 191 46 121 44 Cuts at: 6993 7070 7179 7278 7325 7478 7644 7929 8001 Size: 77 109 99 47 153 166 285 72 Cuts at: 8001 8022 8132 8905 9032 9162 9506 9609 9702 Size: 21 110 773 127 130 344 103 93 Cuts at: 9702 9704 9826 9959 10126 10905 10971 10983 11033 Size: 2 122 133 167 779 66 12 50 Cuts at: 11033 11040 11175 11630 11924 12335 12338 36 Size: 7 135 455 294 411 3 39 Fragments arranged by size: 1091 779 773 736 455 411 375 364 362 344 294 285 238 235 215 191 180 167 166 165 153 135 135 133 130 127 127 122 121 121 113 110 110 110 109 103 100 99 94 93 91 85 84 80 77 72 68 67 66 57 54 53 52 50 47 47 46 45 45 44 42 42 42 42 40 39 39 39 34 33 33 30 29 28 27 25 24 21 19 18 18 18 16 16 15 14 12 12 12 12 11 11 10 10 10 10 10 9 9 9 7 7 6 6 6 4 3 3 3 3 2 AflIII A'CryG_T Cuts at: 1540 4217 4380 4514 11057 12003 12195 1540 Size: 2677 163 134 6543 946 192 1686 Fragments arranged by size: 6543 2677 1686 946 192 163 134 AgeI A'CCGG_T Cuts at: 11 11 Size: 12341 AluI AG'CT Cuts at: 99 118 291 869 998 1117 1126 1147 1153 Size: 19 173 578 129 119 9 21 6 Cuts at: 1153 1164 1218 1698 1844 2129 2136 2380 2507 Size: 11 54 480 146 285 7 244 127 Cuts at: 2507 2687 2841 3170 4550 4577 4597 4651 4923 Size: 180 154 329 1380 27 20 54 272 Cuts at: 4923 4973 4992 5229 5712 5802 5848 6105 6626 Size: 50 19 237 483 90 46 257 521 Cuts at: 6626 6726 6789 7448 7463 7487 9308 9645 9956 Size: 100 63 659 15 24 1821 337 311 Cuts at: 9956 11578 11720 11937 12029 99 Size: 1622 142 217 92 411 Fragments arranged by size: 1821 1622 1380 659 578 521 483 480 411 337 329 311 285 272 257 244 237 217 180 173 154 146 142 129 127 119 100 92 90 63 54 54 50 46 27 24 21 20 19 19 15 11 9 7 6 AlwI GGATCnnnn'n_ Cuts at: 178 401 414 1988 2397 3230 3783 4597 5244 Size: 223 13 1574 409 833 553 814 647 Cuts at: 5244 6105 6191 6193 6289 6290 6753 7070 7074 Size: 861 86 2 96 1 463 317 4 Cuts at: 7074 7460 7727 8038 178 Size: 386 267 311 4481 Fragments arranged by size: 4481 1574 861 833 814 647 553 463 409 386 317 311 267 223 96 86 13 4 2 1 Alw21I G_wGCw'C Cuts at: 1176 3278 3801 4105 5317 5862 7023 7108 9310 Size: 2102 523 304 1212 545 1161 85 2202 Cuts at: 9310 10797 11532 12129 1176 Size: 1487 735 597 1388 Fragments arranged by size: 2202 2102 1487 1388 1212 1161 735 597 545 523 304 85 Alw44I G'TGCA_C Cuts at: 1172 5858 7104 12125 1172 Size: 4686 1246 5021 1388 Fragments arranged by size: 5021 4686 1388 1246 AlwNI CAG_nnn'CTG Cuts at: 3403 3682 5960 7877 11650 3403 Size: 279 2278 1917 3773 4094 Fragments arranged by size: 4094 3773 2278 1917 279 ApaI G_GGCC'C Cuts at: 2118 9161 11118 11992 12211 2118 Size: 7043 1957 874 219 2248 Fragments arranged by size: 7043 2248 1957 874 219 ApaBI GCA_nnnnn'TGC Cuts at: 4803 4858 5191 8092 12089 4803 Size: 55 333 2901 3997 5055 Fragments arranged by size: 5055 3997 2901 333 55 ApoI r'AATT_y Cuts at: 326 894 1253 1639 1805 2468 3149 3964 4409 Size: 568 359 386 166 663 681 815 445 Cuts at: 4409 7430 7594 7705 9278 10049 10102 11319 11489 Size: 3021 164 111 1573 771 53 1217 170 Cuts at: 11489 326 Size: 1178 Fragments arranged by size: 3021 1573 1217 1178 815 771 681 663 568 445 386 359 170 166 164 111 53 AvaI C'yCGr_G Cuts at: 3239 7550 8017 9139 9198 10931 11847 3239 Size: 4311 467 1122 59 1733 916 3733 Fragments arranged by size: 4311 3733 1733 1122 916 467 59 AvaII G'GwC_C Cuts at: 1870 4583 5275 6575 6797 7547 7874 7913 7937 Size: 2713 692 1300 222 750 327 39 24 Cuts at: 7937 8100 9194 9485 9589 10820 11246 11752 11921 Size: 163 1094 291 104 1231 426 506 169 Cuts at: 11921 12179 1870 Size: 258 2032 Fragments arranged by size: 2713 2032 1300 1231 1094 750 692 506 426 327 291 258 222 169 163 104 39 24 AvrII C'CTAG_G Cuts at: 4611 7888 4611 Size: 3277 9064 BaeI ACnnnnGTAyC Cuts at: 1314 11277 1314 Size: 9963 2378 BamHI G'GATC_C Cuts at: 406 406 Size: 12341 BanI G'GyrC_C Cuts at: 428 1156 1509 5344 5428 6385 10936 428 Size: 728 353 3835 84 957 4551 1833 Fragments arranged by size: 4551 3835 1833 957 728 353 84 BanII G_rGCy'C Cuts at: 2118 8017 9161 9310 11118 11134 11992 12211 2118 Size: 5899 1144 149 1808 16 858 219 2248 Fragments arranged by size: 5899 2248 1808 1144 858 219 149 16 BbsI GAAGACnn'nnnn_ Cuts at: 2935 7415 8011 11973 2935 Size: 4480 596 3962 3303 Fragments arranged by size: 4480 3962 3303 596 BbvI GCAGCnnnnnnnn'nnnn_ Cuts at: 8 105 176 300 1581 1831 2329 2494 2850 Size: 97 71 124 1281 250 498 165 356 Cuts at: 2850 3979 4323 4518 4534 4910 4982 5079 5557 Size: 1129 344 195 16 376 72 97 478 Cuts at: 5557 5572 5873 5963 5966 6172 6475 6664 6866 Size: 15 301 90 3 206 303 189 202 Cuts at: 6866 7646 8078 9654 9685 10107 10892 11164 8 Size: 780 432 1576 31 422 785 272 1185 Fragments arranged by size: 1576 1281 1185 1129 785 780 498 478 432 422 376 356 344 303 301 272 250 206 202 195 189 165 124 97 97 90 72 71 31 16 15 3 BccI CCATC Cuts at: 521 2314 3014 3628 4090 4751 5129 5218 5525 Size: 1793 700 614 462 661 378 89 307 Cuts at: 5525 5537 6474 6598 6885 7562 7689 7701 8053 Size: 12 937 124 287 677 127 12 352 Cuts at: 8053 9121 9214 9655 9745 9884 11333 521 Size: 1068 93 441 90 139 1449 1529 Fragments arranged by size: 1793 1529 1449 1068 937 700 677 661 614 462 441 378 352 307 287 139 127 124 93 90 89 12 12 Bce83I CTTGAGnnnnnnnnnnnnnn_nn' Cuts at: 2325 3311 5635 5933 6174 7042 7630 7651 11936 Size: 986 2324 298 241 868 588 21 4285 Cuts at: 11936 2325 Size: 2730 Fragments arranged by size: 4285 2730 2324 986 868 588 298 241 21 BcefI ACGGCnnnnnnnnnnnn'n_ Cuts at: 545 971 3331 3780 3888 3890 4324 5306 6046 Size: 426 2360 449 108 2 434 982 740 Cuts at: 6046 9799 10043 11365 12296 545 Size: 3753 244 1322 931 590 Fragments arranged by size: 3753 2360 1322 982 931 740 590 449 434 426 244 108 2 BcgI CGAnnnnnnTGCnnnnnnnnnn_nn' Cuts at: 6942 6976 6942 Size: 34 12307 BfaI C'TA_G Cuts at: 2 361 1140 1219 1525 2016 2435 2631 3009 Size: 359 779 79 306 491 419 196 378 Cuts at: 3009 4612 6039 6292 6627 7889 9318 11292 11412 Size: 1603 1427 253 335 1262 1429 1974 120 Cuts at: 11412 2 Size: 931 Fragments arranged by size: 1974 1603 1429 1427 1262 931 779 491 419 378 359 335 306 253 196 120 79 BglI GCCn_nnn'nGGC Cuts at: 419 3687 3883 4008 4665 5308 6557 11122 12215 Size: 3268 196 125 657 643 1249 4565 1093 Cuts at: 12215 419 Size: 545 Fragments arranged by size: 4565 3268 1249 1093 657 643 545 196 125 BglII A'GATC_T Cuts at: 1633 5107 1633 Size: 3474 8867 BmgI GkGCCC Cuts at: 429 2116 9136 9159 11063 11116 11990 12209 429 Size: 1687 7020 23 1904 53 874 219 561 Fragments arranged by size: 7020 1904 1687 874 561 219 53 23 BpmI CTGGAGnnnnnnnnnnnnnn_nn' Cuts at: 778 5525 6507 9030 10856 12077 778 Size: 4747 982 2523 1826 1221 1042 Fragments arranged by size: 4747 2523 1826 1221 1042 982 Bpu10I CC'TnA_GC Cuts at: 1122 1589 3675 7616 8026 9509 9564 10844 1122 Size: 467 2086 3941 410 1483 55 1280 2619 Fragments arranged by size: 3941 2619 2086 1483 1280 467 410 55 Bpu1102I GC'TnA_GC Cuts at: 3800 3800 Size: 12341 BsaI GGTCTCn'nnnn_ Cuts at: 6498 8056 9030 6498 Size: 1558 974 9809 Fragments arranged by size: 9809 1558 974 BsaAI yAC'GTr Cuts at: 5085 9328 5085 Size: 4243 8098 BsaBI GATnn'nnATC Cuts at: 175 2624 11335 175 Size: 2449 8711 1181 Fragments arranged by size: 8711 2449 1181 BsaHI Gr'CG_yC Cuts at: 1510 3766 4141 5345 6974 7356 9792 11187 11505 Size: 2256 375 1204 1629 382 2436 1395 318 Cuts at: 11505 1510 Size: 2346 Fragments arranged by size: 2436 2346 2256 1629 1395 1204 382 375 318 BsaJI C'CnnG_G Cuts at: 423 593 662 663 2384 2935 3239 3438 3781 Size: 170 69 1 1721 551 304 199 343 Cuts at: 3781 3805 3954 4611 4660 4669 4705 4883 5306 Size: 24 149 657 49 9 36 178 423 Cuts at: 5306 5508 5704 7888 7963 8016 8017 8104 8833 Size: 202 196 2184 75 53 1 87 729 Cuts at: 8833 8857 8881 8908 8931 8955 8990 9138 9139 Size: 24 24 27 23 24 35 148 1 Cuts at: 9139 9172 9197 9198 9199 9481 9671 9702 10114 Size: 33 25 1 1 282 190 31 412 Cuts at: 10114 10772 10930 10931 10932 11254 11365 11426 11847 Size: 658 158 1 1 322 111 61 421 Cuts at: 11847 11985 11992 11993 423 Size: 138 7 1 771 Fragments arranged by size: 2184 1721 771 729 658 657 551 423 421 412 343 322 304 282 202 199 196 190 178 170 158 149 148 138 111 87 75 69 61 53 49 36 35 33 31 27 25 24 24 24 24 23 9 7 1 1 1 1 1 1 1 1 BsaWI w'CCGG_w Cuts at: 11 898 3491 3834 5750 5897 6728 8058 11 Size: 887 2593 343 1916 147 831 1330 4294 Fragments arranged by size: 4294 2593 1916 1330 887 831 343 147 BsaXI ACnnnnnCTCC Cuts at: 3065 3814 8966 8999 3065 Size: 749 5152 33 6407 Fragments arranged by size: 6407 5152 749 33 BsbI CAACAC Cuts at: 42 2111 2178 3840 5049 6980 9968 11304 12065 Size: 2069 67 1662 1209 1931 2988 1336 761 Cuts at: 12065 12115 42 Size: 50 268 Fragments arranged by size: 2988 2069 1931 1662 1336 1209 761 268 67 50 BscGI CCCGT Cuts at: 64 606 1555 4214 5027 5326 5871 6217 6438 Size: 542 949 2659 813 299 545 346 221 Cuts at: 6438 6462 6984 7977 11135 11483 11791 11866 11975 Size: 24 522 993 3158 348 308 75 109 Cuts at: 11975 12188 64 Size: 213 217 Fragments arranged by size: 3158 2659 993 949 813 545 542 522 348 346 308 299 221 217 213 109 75 24 BseRI GAGGAGnnnnnnnn_nn' Cuts at: 2363 2390 2983 4621 7555 8010 8181 8199 8244 Size: 27 593 1638 2934 455 171 18 45 Cuts at: 8244 8262 8298 8316 8343 8379 8397 8424 8460 Size: 18 36 18 27 36 18 27 36 Cuts at: 8460 8526 8679 8706 8805 8856 8880 8904 12270 Size: 66 153 27 99 51 24 24 3366 Cuts at: 12270 2363 Size: 2434 Fragments arranged by size: 3366 2934 2434 1638 593 455 171 153 99 66 51 45 36 36 36 27 27 27 27 24 24 18 18 18 18 BsgI GTGCAGnnnnnnnnnnnnnn_nn' Cuts at: 2857 4031 7768 9661 2857 Size: 1174 3737 1893 5537 Fragments arranged by size: 5537 3737 1893 1174 BsiI C'TCGT_G Cuts at: 5717 7101 7408 10807 11681 5717 Size: 1384 307 3399 874 6377 Fragments arranged by size: 6377 3399 1384 874 307 BsiEI CG_ry'CG Cuts at: 12 1137 1314 5884 6807 6956 12 Size: 1125 177 4570 923 149 5397 Fragments arranged by size: 5397 4570 1125 923 177 149 BslI CCnn_nnn'nnGG Cuts at: 112 425 669 1336 1797 1798 2327 3090 3443 Size: 313 244 667 461 1 529 763 353 Cuts at: 3443 3471 3745 4072 4117 4711 4982 5460 5509 Size: 28 274 327 45 594 271 478 49 Cuts at: 5509 5584 5750 6029 7533 7743 7871 7883 9047 Size: 75 166 279 1504 210 128 12 1164 Cuts at: 9047 9076 9179 9191 9205 9488 9500 9511 9917 Size: 29 103 12 14 283 12 11 406 Cuts at: 9917 9918 10062 10119 10837 10899 11039 11255 11366 Size: 1 144 57 718 62 140 216 111 Cuts at: 11366 11871 11917 11918 11930 11997 12017 12238 12317 Size: 505 46 1 12 67 20 221 79 Cuts at: 12317 112 Size: 136 Fragments arranged by size: 1504 1164 763 718 667 594 529 505 478 461 406 353 327 313 283 279 274 271 244 221 216 210 166 144 140 136 128 111 103 79 75 67 62 57 49 46 45 29 28 20 14 12 12 12 12 11 1 1 1 BsmI GAATG_Cn' Cuts at: 263 356 500 907 1748 2444 2537 3054 5498 Size: 93 144 407 841 696 93 517 2444 Cuts at: 5498 263 Size: 7106 Fragments arranged by size: 7106 2444 841 696 517 407 144 93 93 BsmAI GTCTCn'nnnn_ Cuts at: 113 670 3902 4203 4974 6498 7274 7896 8056 Size: 557 3232 301 771 1524 776 622 160 Cuts at: 8056 9030 9467 9783 11152 113 Size: 974 437 316 1369 1302 Fragments arranged by size: 3232 1524 1369 1302 974 776 771 622 557 437 316 301 160 BsmBI CGTCTCn'nnnn_ Cuts at: 113 670 3902 4203 4974 9467 9783 113 Size: 557 3232 301 771 4493 316 2671 Fragments arranged by size: 4493 3232 2671 771 557 316 301 BsmFI GGGACnnnnnnnnnn'nnnn_ Cuts at: 1488 1513 1769 2217 4228 4782 4901 5237 7533 Size: 25 256 448 2011 554 119 336 2296 Cuts at: 7533 7600 8113 8982 11232 11271 11341 11992 12165 Size: 67 513 869 2250 39 70 651 173 Cuts at: 12165 1488 Size: 1664 Fragments arranged by size: 2296 2250 2011 1664 869 651 554 513 448 336 256 173 119 70 67 39 25 BsoFI GC'n_GC Cuts at: 22 119 165 289 555 1134 1137 1570 1845 Size: 97 46 124 266 579 3 433 275 Cuts at: 1845 2318 2508 2839 3346 3349 3704 3846 3898 Size: 473 190 331 507 3 355 142 52 Cuts at: 3898 3993 4009 4026 4066 4094 4097 4182 4312 Size: 95 16 17 40 28 3 85 130 Cuts at: 4312 4357 4360 4523 4532 4666 4924 4971 5068 Size: 45 3 163 9 134 258 47 97 Cuts at: 5068 5163 5246 5303 5348 5427 5546 5549 5556 Size: 95 83 57 45 79 119 3 7 Cuts at: 5556 5561 5589 5744 5887 5952 5955 6161 6489 Size: 5 28 155 143 65 3 206 328 Cuts at: 6489 6678 6828 6855 6950 7179 7478 7660 7930 Size: 189 150 27 95 229 299 182 270 Cuts at: 7930 8023 8092 8905 9643 9699 9702 10096 10127 Size: 93 69 813 738 56 3 394 31 Cuts at: 10127 10881 11041 11178 12336 22 Size: 754 160 137 1158 27 Fragments arranged by size: 1158 813 754 738 579 507 473 433 394 355 331 328 299 275 270 266 258 229 206 190 189 182 163 160 155 150 143 142 137 134 130 124 119 97 97 95 95 95 93 85 83 79 69 65 57 56 52 47 46 45 45 40 31 28 28 27 27 17 16 9 7 5 3 3 3 3 3 3 3 Bsp24I GACnnnnnnTGGnnnnnnn_nnnnn' Cuts at: 1 33 1261 1293 6037 6069 6215 6247 7341 Size: 32 1228 32 4744 32 146 32 1094 Cuts at: 7341 7373 8092 8124 11151 11183 11707 11739 1 Size: 32 719 32 3027 32 524 32 603 Fragments arranged by size: 4744 3027 1228 1094 719 603 524 146 32 32 32 32 32 32 32 32 Bsp1286I G_dGCh'C Cuts at: 431 1176 2118 3278 3801 4105 5317 5862 7023 Size: 745 942 1160 523 304 1212 545 1161 Cuts at: 7023 7108 8017 9138 9161 9310 10797 11065 11118 Size: 85 909 1121 23 149 1487 268 53 Cuts at: 11118 11134 11532 11992 12129 12211 431 Size: 16 398 460 137 82 561 Fragments arranged by size: 1487 1212 1161 1160 1121 942 909 745 561 545 523 460 398 304 268 149 137 85 82 53 23 16 BspEI T'CCGG_A Cuts at: 898 3491 8058 898 Size: 2593 4567 5181 Fragments arranged by size: 5181 4567 2593 BspGI CTGGAC Cuts at: 5198 5275 7574 7913 9194 9485 5198 Size: 77 2299 339 1281 291 8054 Fragments arranged by size: 8054 2299 1281 339 291 77 BspLU11I A'CATG_T Cuts at: 12003 12195 12003 Size: 192 12149 BspMI ACCTGCnnnn'nnnn_ Cuts at: 1626 3805 4233 5193 9626 10912 1626 Size: 2179 428 960 4433 1286 3055 Fragments arranged by size: 4433 3055 2179 1286 960 428 BsrI ACTG_Gn' Cuts at: 653 1093 1973 3524 3673 3715 3862 4556 4733 Size: 440 880 1551 149 42 147 694 177 Cuts at: 4733 5078 5277 5952 5965 6077 6483 6601 6644 Size: 345 199 675 13 112 406 118 43 Cuts at: 6644 6913 7083 7504 9000 9196 9846 10166 11165 Size: 269 170 421 1496 196 650 320 999 Cuts at: 11165 11276 11340 12211 653 Size: 111 64 871 783 Fragments arranged by size: 1551 1496 999 880 871 783 694 675 650 440 421 406 345 320 269 199 196 177 170 149 147 118 112 111 64 43 42 13 BsrBI GAG'CGG Cuts at: 3378 4008 4171 7278 8132 9611 11632 3378 Size: 630 163 3107 854 1479 2021 4087 Fragments arranged by size: 4087 3107 2021 1479 854 630 163 BsrDI GCAATG_nn' Cuts at: 881 1252 3579 3757 4135 6498 6672 9288 12062 Size: 371 2327 178 378 2363 174 2616 2774 Cuts at: 12062 881 Size: 1160 Fragments arranged by size: 2774 2616 2363 2327 1160 378 371 178 174 BsrFI r'CCGG_y Cuts at: 11 418 3506 4137 4352 5422 6517 9362 11 Size: 407 3088 631 215 1070 1095 2845 2990 Fragments arranged by size: 3088 2990 2845 1095 1070 631 407 215 BssHII G'CGCG_C Cuts at: 3575 3699 4021 4133 4348 3575 Size: 124 322 112 215 11568 Fragments arranged by size: 11568 322 215 124 112 BstEII G'GTnAC_C Cuts at: 7522 7522 Size: 12341 BstXI CCAn_nnnn'nTGG Cuts at: 9110 10457 10753 11126 9110 Size: 1347 296 373 10325 Fragments arranged by size: 10325 1347 373 296 BstYI r'GATC_y Cuts at: 406 1633 3235 4589 5107 6185 6196 6282 6294 Size: 1227 1602 1354 518 1078 11 86 12 Cuts at: 6294 7062 7079 7719 406 Size: 768 17 640 5028 Fragments arranged by size: 5028 1602 1354 1227 1078 768 640 518 86 17 12 11 Bsu36I CC'TnA_GG Cuts at: 1469 9407 11748 1469 Size: 7938 2341 2062 Fragments arranged by size: 7938 2341 2062 Cac8I GCn'nGC Cuts at: 420 552 920 1141 1145 1342 1623 1627 2872 Size: 132 368 221 4 197 281 4 1245 Cuts at: 2872 3284 3388 3547 3577 3683 3701 3748 3884 Size: 412 104 159 30 106 18 47 136 Cuts at: 3884 3915 4019 4023 4050 4101 4135 4139 4148 Size: 31 104 4 27 51 34 4 9 Cuts at: 4148 4230 4239 4350 4354 4529 4798 4817 4853 Size: 82 9 111 4 175 269 19 36 Cuts at: 4853 4872 5177 5186 5243 5313 5424 5553 5598 Size: 19 305 9 57 70 111 129 45 Cuts at: 5598 6158 6549 6682 9038 9221 9506 9609 9862 Size: 560 391 133 2356 183 285 103 253 Cuts at: 9862 10078 10905 11061 11603 11630 420 Size: 216 827 156 542 27 1131 Fragments arranged by size: 2356 1245 1131 827 560 542 412 391 368 305 285 281 269 253 221 216 197 183 175 159 156 136 133 132 129 111 111 106 104 104 103 82 70 57 51 47 45 36 34 31 30 27 27 19 19 18 9 9 9 4 4 4 4 4 CjeI CCAnnnnnnGTnnnnnnnnn'nnnnnn_ Cuts at: 28 1143 1176 1255 1288 2286 2319 3701 3734 Size: 1115 33 79 33 998 33 1382 33 Cuts at: 3734 3959 3992 4620 4653 5557 5590 6031 6064 Size: 225 33 628 33 904 33 441 33 Cuts at: 6064 6109 6112 6142 6145 6209 6242 7335 7368 Size: 45 3 30 3 64 33 1093 33 Cuts at: 7368 7855 7888 8086 8119 9505 9538 9666 9699 Size: 487 33 198 33 1386 33 128 33 Cuts at: 9699 10926 10959 11145 11178 11221 11254 11701 11734 Size: 1227 33 186 33 43 33 447 33 Cuts at: 11734 11998 12031 12092 12125 12336 28 Size: 264 33 61 33 211 33 Fragments arranged by size: 1386 1382 1227 1115 1093 998 904 628 487 447 441 264 225 211 198 186 128 79 64 61 45 43 33 33 33 33 33 33 33 33 33 33 33 33 33 33 33 33 33 33 33 33 33 30 3 3 CjePI GAnnnnnnnTGGnnnnnnn'nnnnnn_ Cuts at: 28 1255 1288 1305 1338 2071 2104 2290 2323 Size: 1227 33 17 33 733 33 186 33 Cuts at: 2323 2914 2947 3045 3078 3604 3637 5105 5124 Size: 591 33 98 33 526 33 1468 19 Cuts at: 5124 5138 5157 6031 6063 6064 6096 6209 6242 Size: 14 19 874 32 1 32 113 33 Cuts at: 6242 6329 6362 6801 6834 7335 7368 8086 8119 Size: 87 33 439 33 501 33 718 33 Cuts at: 8119 8947 8980 9291 9324 9332 9365 9832 9865 Size: 828 33 311 33 8 33 467 33 Cuts at: 9865 11145 11177 11178 11210 11701 11734 11939 11972 Size: 1280 32 1 32 491 33 205 33 Cuts at: 11972 12336 28 Size: 364 33 Fragments arranged by size: 1468 1280 1227 874 828 733 718 591 526 501 491 467 439 364 311 205 186 113 98 87 33 33 33 33 33 33 33 33 33 33 33 33 33 33 33 33 33 33 33 32 32 32 32 19 19 17 14 8 1 1 ClaI AT'CG_AT Cuts at: 3891 7456 3891 Size: 3565 8776 CviJI rG'Cy Cuts at: 21 66 99 118 167 182 291 413 422 Size: 45 33 19 49 15 109 122 9 Cuts at: 422 519 631 673 718 869 940 985 998 Size: 97 112 42 45 151 71 45 13 Cuts at: 998 1117 1126 1136 1147 1153 1164 1218 1500 Size: 119 9 10 11 6 11 54 282 Cuts at: 1500 1553 1698 1844 1947 2116 2129 2136 2167 Size: 53 145 146 103 169 13 7 31 Cuts at: 2167 2320 2380 2507 2617 2687 2841 2997 3170 Size: 153 60 127 110 70 154 156 173 Cuts at: 3170 3244 3386 3443 3464 3545 3610 3681 3794 Size: 74 142 57 21 81 65 71 113 Cuts at: 3794 3804 3877 3882 3897 3917 3933 3959 4002 Size: 10 73 5 15 20 16 26 43 Cuts at: 4002 4176 4181 4246 4544 4550 4577 4597 4610 Size: 174 5 65 298 6 27 20 13 Cuts at: 4610 4616 4628 4651 4659 4668 4674 4704 4827 Size: 6 12 23 8 9 6 30 123 Cuts at: 4827 4882 4923 4973 4992 5025 5070 5123 5131 Size: 55 41 50 19 33 45 53 8 Cuts at: 5131 5188 5229 5248 5258 5396 5401 5422 5466 Size: 57 41 19 10 138 5 21 44 Cuts at: 5466 5548 5570 5588 5614 5712 5802 5848 5853 Size: 82 22 18 26 98 90 46 5 Cuts at: 5853 5878 5957 6022 6033 6076 6105 6468 6480 Size: 25 79 65 11 43 29 363 12 Cuts at: 6480 6521 6547 6551 6560 6626 6716 6726 6789 Size: 41 26 4 9 66 90 10 63 Cuts at: 6789 6827 7414 7448 7463 7477 7487 7603 7608 Size: 38 587 34 15 14 10 116 5 Cuts at: 7608 7615 7659 7762 7864 7887 7923 8015 8025 Size: 7 44 103 102 23 36 92 10 Cuts at: 8025 8038 8091 8832 8856 8880 8904 8930 8954 Size: 13 53 741 24 24 24 26 24 Cuts at: 8954 8989 9040 9058 9083 9114 9127 9159 9183 Size: 35 51 18 25 31 13 32 24 Cuts at: 9183 9308 9317 9479 9492 9504 9607 9645 9698 Size: 125 9 162 13 12 103 38 53 Cuts at: 9698 9813 9882 9956 10030 10036 10041 10289 10379 Size: 115 69 74 74 6 5 248 90 Cuts at: 10379 10615 10705 10786 10903 10998 11053 11095 11116 Size: 236 90 81 117 95 55 42 21 Cuts at: 11116 11132 11314 11352 11578 11647 11720 11887 11937 Size: 16 182 38 226 69 73 167 50 Cuts at: 11937 11946 11970 11990 12029 12035 12105 12209 21 Size: 9 24 20 39 6 70 104 153 Fragments arranged by size: 741 587 363 298 282 248 236 226 182 174 173 169 167 162 156 154 153 153 151 146 145 142 138 127 125 123 122 119 117 116 115 113 112 110 109 104 103 103 103 102 98 97 95 92 90 90 90 90 82 81 81 79 74 74 74 73 73 71 71 70 70 69 69 66 65 65 65 63 60 57 57 55 55 54 53 53 53 53 51 50 50 49 46 45 45 45 45 44 44 43 43 42 42 41 41 41 39 38 38 38 36 35 34 33 33 32 31 31 30 29 27 26 26 26 26 25 25 24 24 24 24 24 24 23 23 22 21 21 21 20 20 20 19 19 19 18 18 16 16 15 15 15 14 13 13 13 13 13 13 12 12 12 11 11 11 10 10 10 10 10 10 9 9 9 9 9 9 8 8 7 7 6 6 6 6 6 6 5 5 5 5 5 5 4 CviRI TG'CA Cuts at: 121 261 288 356 1174 1245 1344 1400 1419 Size: 140 27 68 818 71 99 56 19 Cuts at: 1419 1447 1606 1621 1629 1748 1847 2065 2124 Size: 28 159 15 8 119 99 218 59 Cuts at: 2124 2442 2510 2537 2838 4048 4604 4680 4796 Size: 318 68 27 301 1210 556 76 116 Cuts at: 4796 4805 4851 4860 4970 5184 5389 5860 6156 Size: 9 46 9 110 214 205 471 296 Cuts at: 6156 6491 6581 6680 6774 6862 7106 7785 8085 Size: 335 90 99 94 88 244 679 300 Cuts at: 8085 8094 9293 9621 9642 10080 10135 10188 10921 Size: 9 1199 328 21 438 55 53 733 Cuts at: 10921 11289 12068 12082 12127 12251 121 Size: 368 779 14 45 124 211 Fragments arranged by size: 1210 1199 818 779 733 679 556 471 438 368 335 328 318 301 300 296 244 218 214 211 205 159 140 124 119 116 110 99 99 99 94 90 88 76 71 68 68 59 56 55 53 46 45 28 27 27 21 19 15 14 9 9 9 8 DdeI C'TnA_G Cuts at: 674 1122 1469 1533 1589 1714 2231 2913 3025 Size: 448 347 64 56 125 517 682 112 Cuts at: 3025 3164 3245 3259 3675 3800 4341 4593 4652 Size: 139 81 14 416 125 541 252 59 Cuts at: 4652 5819 6228 6394 6934 7360 7616 7801 8026 Size: 1167 409 166 540 426 256 185 225 Cuts at: 8026 9407 9509 9564 9952 10057 10798 10844 11559 Size: 1381 102 55 388 105 741 46 715 Cuts at: 11559 11748 12109 674 Size: 189 361 906 Fragments arranged by size: 1381 1167 906 741 715 682 541 540 517 448 426 416 409 388 361 347 256 252 225 189 185 166 139 125 125 112 105 102 81 64 59 56 55 46 14 DpnI GA'TC Cuts at: 172 408 1313 1635 1995 2391 2627 3237 3777 Size: 236 905 322 360 396 236 610 540 Cuts at: 3777 3858 4365 4591 5109 5238 5269 5284 6112 Size: 81 507 226 518 129 31 15 828 Cuts at: 6112 6187 6198 6206 6284 6296 6401 6742 6760 Size: 75 11 8 78 12 105 341 18 Cuts at: 6760 6806 7064 7081 7117 7467 7721 7831 8032 Size: 46 258 17 36 350 254 110 201 Cuts at: 8032 10877 11640 172 Size: 2845 763 873 Fragments arranged by size: 2845 905 873 828 763 610 540 518 507 396 360 350 341 322 258 254 236 236 226 201 129 110 105 81 78 75 46 36 31 18 17 15 12 11 8 DraI TTT'AAA Cuts at: 215 639 978 1657 2221 2584 3174 6303 6322 Size: 424 339 679 564 363 590 3129 19 Cuts at: 6322 7014 215 Size: 692 5542 Fragments arranged by size: 5542 3129 692 679 590 564 424 363 339 19 DraIII CAC_nnn'GTG Cuts at: 12112 12112 Size: 12341 DrdI GACnn_nn'nnGTC Cuts at: 67 5026 5652 9201 12084 67 Size: 4959 626 3549 2883 324 Fragments arranged by size: 4959 3549 2883 626 324 DrdII GAACCA Cuts at: 1263 3489 4110 7691 11233 11671 1263 Size: 2226 621 3581 3542 438 1933 Fragments arranged by size: 3581 3542 2226 1933 621 438 DsaI C'CryG_G Cuts at: 593 4705 7963 8104 9702 10772 11365 593 Size: 4112 3258 141 1598 1070 593 1569 Fragments arranged by size: 4112 3258 1598 1569 1070 593 141 EaeI y'GGCC_r Cuts at: 420 629 1134 6825 9880 11093 420 Size: 209 505 5691 3055 1213 1668 Fragments arranged by size: 5691 3055 1668 1213 505 209 EagI C'GGCC_G Cuts at: 1134 1134 Size: 12341 Eam1105I GACnn_n'nnGTC Cuts at: 6437 11340 6437 Size: 4903 7438 EarI CTCTTCn'nnn_ Cuts at: 2961 4161 4373 7232 7526 7532 7942 7975 2961 Size: 1200 212 2859 294 6 410 33 7327 Fragments arranged by size: 7327 2859 1200 410 294 212 33 6 EciI TCCGCC Cuts at: 3511 3713 3737 4501 4713 4724 4734 4755 5534 Size: 202 24 764 212 11 10 21 779 Cuts at: 5534 5618 5764 6592 8002 3511 Size: 84 146 828 1410 7850 Fragments arranged by size: 7850 1410 828 779 764 212 202 146 84 24 21 11 10 Eco47III AGC'GCT Cuts at: 4388 4417 12277 4388 Size: 29 7860 4452 Fragments arranged by size: 7860 4452 29 Eco57I CTGAAGnnnnnnnnnnnnnn_nn' Cuts at: 1133 2944 3853 4354 6092 7104 11627 12015 12257 Size: 1811 909 501 1738 1012 4523 388 242 Cuts at: 12257 1133 Size: 1217 Fragments arranged by size: 4523 1811 1738 1217 1012 909 501 388 242 EcoNI CCTnn'n_nnAGG Cuts at: 7531 7531 Size: 12341 EcoO109I rG'GnC_Cy Cuts at: 2115 3679 7413 7547 7874 8100 9039 9157 9158 Size: 1564 3734 134 327 226 939 118 1 Cuts at: 9158 9589 11115 11752 11885 11945 11989 12207 2115 Size: 431 1526 637 133 60 44 218 2249 Fragments arranged by size: 3734 2249 1564 1526 939 637 431 327 226 218 134 133 118 60 44 1 EcoRI G'AATT_C Cuts at: 894 1253 1639 7430 894 Size: 359 386 5791 5805 Fragments arranged by size: 5805 5791 386 359 EcoRII 'CCwGG_ Cuts at: 662 718 1128 2383 3780 3804 4241 4827 4882 Size: 56 410 1255 1397 24 437 586 55 Cuts at: 4882 5197 5570 5691 5704 7603 7715 7864 7876 Size: 315 373 121 13 1899 112 149 12 Cuts at: 7876 8008 8930 8954 8990 9046 9172 9312 9481 Size: 132 922 24 36 56 126 140 169 Cuts at: 9481 9499 9671 10003 10036 11253 11984 11992 12093 Size: 18 172 332 33 1217 731 8 101 Cuts at: 12093 662 Size: 910 Fragments arranged by size: 1899 1397 1255 1217 922 910 731 586 437 410 373 332 315 172 169 149 140 132 126 121 112 101 56 56 55 36 33 24 24 18 13 12 8 EcoRV GAT'ATC Cuts at: 11737 11737 Size: 12341 FauI CCCGCnnnn'nn_ Cuts at: 43 53 467 911 1510 3395 3739 4133 4738 Size: 10 414 444 599 1885 344 394 605 Cuts at: 4738 4759 5036 5046 5184 5379 7637 8125 9169 Size: 21 277 10 138 195 2258 488 1044 Cuts at: 9169 9513 9616 9833 10912 10976 11637 43 Size: 344 103 217 1079 64 661 747 Fragments arranged by size: 2258 1885 1079 1044 747 661 605 599 488 444 414 394 344 344 277 217 195 138 103 64 21 10 10 FokI GGATGnnnnnnnnn'nnnn_ Cuts at: 68 914 2324 3399 3548 3605 4108 4761 5019 Size: 846 1410 1075 149 57 503 653 258 Cuts at: 5019 5139 5184 6403 6584 6871 7548 7648 7699 Size: 120 45 1219 181 287 677 100 51 Cuts at: 7699 7711 7759 9004 9590 11323 12110 12116 12156 Size: 12 48 1245 586 1733 787 6 40 Cuts at: 12156 68 Size: 253 Fragments arranged by size: 1733 1410 1245 1219 1075 846 787 677 653 586 503 287 258 253 181 149 120 100 57 51 48 45 40 12 6 FspI TGC'GCA Cuts at: 5497 6659 5497 Size: 1162 11179 GdiII y'GGCC_G Cuts at: 420 1134 6825 420 Size: 714 5691 5936 Fragments arranged by size: 5936 5691 714 HaeI wGG'CCw Cuts at: 631 718 4002 4616 5131 5188 5570 6022 7603 Size: 87 3284 614 515 57 382 452 1581 Cuts at: 7603 7887 9058 9882 10041 11095 631 Size: 284 1171 824 159 1054 1877 Fragments arranged by size: 3284 1877 1581 1171 1054 824 614 515 452 382 284 159 87 57 HaeII r_GCGC'y Cuts at: 1513 3675 4390 4419 5348 5792 10844 12279 1513 Size: 2162 715 29 929 444 5052 1435 1575 Fragments arranged by size: 5052 2162 1575 1435 929 715 444 29 HaeIII GG'CC Cuts at: 413 422 631 718 940 985 1136 1553 2116 Size: 9 209 87 222 45 151 417 563 Cuts at: 2116 3610 3681 3794 3877 3959 4002 4616 4659 Size: 1494 71 113 83 82 43 614 43 Cuts at: 4659 4668 4674 5131 5188 5401 5570 5588 6022 Size: 9 6 457 57 213 169 18 434 Cuts at: 6022 6480 6560 6827 7414 7477 7603 7864 7887 Size: 458 80 267 587 63 126 261 23 Cuts at: 7887 8038 8832 8856 8880 8904 8989 9040 9058 Size: 151 794 24 24 24 85 51 18 Cuts at: 9058 9114 9159 9183 9479 9492 9504 9882 10041 Size: 56 45 24 296 13 12 378 159 Cuts at: 10041 10903 11095 11116 11887 11946 11990 12209 413 Size: 862 192 21 771 59 44 219 545 Fragments arranged by size: 1494 862 794 771 614 587 563 545 458 457 434 417 378 296 267 261 222 219 213 209 192 169 159 151 151 126 113 87 85 83 82 80 71 63 59 57 56 51 45 45 44 43 43 24 24 24 24 23 21 18 18 13 12 9 9 6 HgaI GACGCnnnnn'nnnnn_ Cuts at: 60 3264 3575 3641 3755 3919 4130 4225 4262 Size: 3204 311 66 114 164 211 95 37 Cuts at: 4262 4354 4388 4505 4522 5026 5124 5368 5518 Size: 92 34 117 17 504 98 244 150 Cuts at: 5518 5655 6233 6963 7630 7794 9800 11065 11176 Size: 137 578 730 667 164 2006 1265 111 Cuts at: 11176 11494 60 Size: 318 907 Fragments arranged by size: 3204 2006 1265 907 730 667 578 504 318 311 244 211 164 164 150 137 117 114 111 98 95 92 66 37 34 17 HgiEII ACCnnnnnnGGT Cuts at: 2035 6130 11242 2035 Size: 4095 5112 3134 Fragments arranged by size: 5112 4095 3134 HhaI G_CG'C Cuts at: 26 56 159 1512 1574 3307 3551 3577 3579 Size: 30 103 1353 62 1733 244 26 2 Cuts at: 3579 3586 3642 3674 3701 3703 3845 3902 4023 Size: 7 56 32 27 2 142 57 121 Cuts at: 4023 4025 4065 4135 4137 4281 4350 4352 4389 Size: 2 40 70 2 144 69 2 37 Cuts at: 4389 4418 4447 4527 4933 5037 5067 5347 5498 Size: 29 29 80 406 104 30 280 151 Cuts at: 5498 5560 5724 5791 5891 6065 6174 6567 6660 Size: 62 164 67 100 174 109 393 93 Cuts at: 6660 6997 7329 9036 9225 9963 10843 10851 10891 Size: 337 332 1707 189 738 880 8 40 Cuts at: 10891 12278 26 Size: 1387 89 Fragments arranged by size: 1733 1707 1387 1353 880 738 406 393 337 332 280 244 189 174 164 151 144 142 121 109 104 103 100 93 89 80 70 69 67 62 62 57 56 40 40 37 32 30 30 29 29 27 26 8 7 2 2 2 2 2 Hin4I GAbnnnnnvTC Cuts at: 909 1875 2630 3671 3814 4010 4666 5280 6436 Size: 966 755 1041 143 196 656 614 1156 Cuts at: 6436 6510 7448 7544 8053 9793 11339 909 Size: 74 938 96 509 1740 1546 1911 Fragments arranged by size: 1911 1740 1546 1156 1041 966 938 755 656 614 509 196 143 96 74 HincII GTy'rAC Cuts at: 9 275 1615 1916 2155 2523 3720 6978 11877 Size: 266 1340 301 239 368 1197 3258 4899 Cuts at: 11877 12149 9 Size: 272 201 Fragments arranged by size: 4899 3258 1340 1197 368 301 272 266 239 201 HindIII A'AGCT_T Cuts at: 1145 1145 Size: 12341 HinfI G'AnT_C Cuts at: 5 545 1476 1596 2902 2985 3094 3118 3513 Size: 540 931 120 1306 83 109 24 395 Cuts at: 3513 3786 3987 5145 5443 5915 6432 7555 7779 Size: 273 201 1158 298 472 517 1123 224 Cuts at: 7779 7845 8995 9322 9457 9515 11171 11610 11687 Size: 66 1150 327 135 58 1656 439 77 Cuts at: 11687 5 Size: 659 Fragments arranged by size: 1656 1306 1158 1150 1123 931 659 540 517 472 439 395 327 298 273 224 201 135 120 109 83 77 66 58 24 HpaI GTT'AAC Cuts at: 275 2523 11877 275 Size: 2248 9354 739 Fragments arranged by size: 9354 2248 739 HphI GGTGAnnnnnnn_n' Cuts at: 130 139 609 651 663 719 855 857 863 Size: 9 470 42 12 56 136 2 6 Cuts at: 863 1198 3496 3770 3851 4388 4432 4952 4961 Size: 335 2298 274 81 537 44 520 9 Cuts at: 4961 5438 6280 6507 6923 7129 7164 7534 7684 Size: 477 842 227 416 206 35 370 150 Cuts at: 7684 7967 9134 9221 9643 9722 9752 9767 9887 Size: 283 1167 87 422 79 30 15 120 Cuts at: 9887 10019 10045 11227 11500 130 Size: 132 26 1182 273 971 Fragments arranged by size: 2298 1182 1167 971 842 537 520 477 470 422 416 370 335 283 274 273 227 206 150 136 132 120 87 81 79 56 44 42 35 30 26 15 12 9 9 6 2 KpnI G_GTAC'C Cuts at: 1160 1160 Size: 12341 MaeII A'CG_T Cuts at: 634 809 3338 3722 3926 4032 4291 5084 6247 Size: 175 2529 384 204 106 259 793 1163 Cuts at: 6247 6663 7036 7356 8074 8920 8974 9132 9327 Size: 416 373 320 718 846 54 158 195 Cuts at: 9327 9946 11959 634 Size: 619 2013 1016 Fragments arranged by size: 2529 2013 1163 1016 846 793 718 619 416 384 373 320 259 204 195 175 158 106 54 MaeIII 'GTnAC_ Cuts at: 101 300 731 836 1388 1700 1727 1892 2279 Size: 199 431 105 552 312 27 165 387 Cuts at: 2279 2493 2798 3203 3311 3653 3938 4220 4376 Size: 214 305 405 108 342 285 282 156 Cuts at: 4376 4391 4438 4985 5080 5286 5900 5963 6079 Size: 15 47 547 95 206 614 63 116 Cuts at: 6079 6362 6693 6751 6904 7092 7522 9323 9631 Size: 283 331 58 153 188 430 1801 308 Cuts at: 9631 9776 9893 9942 9947 10987 11207 11221 11506 Size: 145 117 49 5 1040 220 14 285 Cuts at: 11506 11658 11713 11797 12041 12191 101 Size: 152 55 84 244 150 251 Fragments arranged by size: 1801 1040 614 552 547 431 430 405 387 342 331 312 308 305 285 285 283 282 251 244 220 214 206 199 188 165 156 153 152 150 145 117 116 108 105 95 84 63 58 55 49 47 27 15 14 5 MboII GAAGAnnnnnnn_n' Cuts at: 624 1591 2935 2948 3013 4178 4360 5140 6206 Size: 967 1344 13 65 1165 182 780 1066 Cuts at: 6206 6277 7032 7110 7219 7415 7484 7543 7549 Size: 71 755 78 109 196 69 59 6 Cuts at: 7549 7959 7992 8016 11607 11619 11633 11973 12305 Size: 410 33 24 3591 12 14 340 332 Cuts at: 12305 624 Size: 660 Fragments arranged by size: 3591 1344 1165 1066 967 780 755 660 410 340 332 196 182 109 78 71 69 65 59 33 24 14 13 12 6 MluI A'CGCG_T Cuts at: 1540 4217 4380 4514 11057 1540 Size: 2677 163 134 6543 2824 Fragments arranged by size: 6543 2824 2677 163 134 MmeI TCCrACnnnnnnnnnnnnnnnnnn_nn' Cuts at: 3071 5759 5943 7746 9294 9961 3071 Size: 2688 184 1803 1548 667 5451 Fragments arranged by size: 5451 2688 1803 1548 667 184 MnlI CCTCnnnnnn_n' Cuts at: 124 154 192 232 240 1053 1162 1448 1464 Size: 30 38 40 8 813 109 286 16 Cuts at: 1464 1542 1655 1709 2064 2289 2298 2341 2344 Size: 78 113 54 355 225 9 43 3 Cuts at: 2344 2347 2359 2368 2559 2568 2608 2961 3008 Size: 3 12 9 191 9 40 353 47 Cuts at: 3008 3053 3286 3743 4066 4490 4627 4639 4642 Size: 45 233 457 323 424 137 12 3 Cuts at: 4642 4649 4655 4679 4685 4937 4968 5113 5316 Size: 7 6 24 6 252 31 145 203 Cuts at: 5316 5377 5415 5442 5652 5726 5976 6376 6457 Size: 61 38 27 210 74 250 400 81 Cuts at: 6457 6604 6810 7404 7479 7527 7533 7536 7584 Size: 147 206 594 75 48 6 3 48 Cuts at: 7584 7593 7605 7626 7671 7677 7689 7743 7762 Size: 9 12 21 45 6 12 54 19 Cuts at: 7762 7852 7943 7950 7964 7976 7982 7988 7991 Size: 90 91 7 14 12 6 6 3 Cuts at: 7991 8129 8144 8159 8162 8177 8180 8189 8198 Size: 138 15 15 3 15 3 9 9 Cuts at: 8198 8207 8222 8225 8240 8243 8252 8261 8276 Size: 9 15 3 15 3 9 9 15 Cuts at: 8276 8279 8294 8297 8306 8321 8324 8333 8342 Size: 3 15 3 9 15 3 9 9 Cuts at: 8342 8357 8360 8375 8378 8387 8402 8405 8414 Size: 15 3 15 3 9 15 3 9 Cuts at: 8414 8423 8438 8441 8456 8465 8474 8489 8504 Size: 9 15 3 15 9 9 15 15 Cuts at: 8504 8507 8516 8525 8540 8555 8570 8585 8594 Size: 3 9 9 15 15 15 15 9 Cuts at: 8594 8609 8618 8633 8642 8657 8660 8669 8684 Size: 15 9 15 9 15 3 9 15 Cuts at: 8684 8687 8696 8711 8720 8735 8744 8759 8768 Size: 3 9 15 9 15 9 15 9 Cuts at: 8768 8783 8786 8801 8816 8822 8834 8837 8846 Size: 15 3 15 15 6 12 3 9 Cuts at: 8846 8858 8861 8870 8882 8885 8894 8909 8957 Size: 12 3 9 12 3 9 15 48 Cuts at: 8957 8979 9054 9209 9227 9257 9374 9403 9407 Size: 22 75 155 18 30 117 29 4 Cuts at: 9407 9559 9678 9700 9731 9745 9751 9806 9918 Size: 152 119 22 31 14 6 55 112 Cuts at: 9918 10052 10113 10185 10811 10816 10880 11432 11543 Size: 134 61 72 626 5 64 552 111 Cuts at: 11543 11690 11911 11922 11959 11981 11991 12291 124 Size: 147 221 11 37 22 10 300 174 Fragments arranged by size: 813 626 594 552 457 424 400 355 353 323 300 286 252 250 233 225 221 210 206 203 191 174 155 152 147 147 145 138 137 134 119 117 113 112 111 109 91 90 81 78 75 75 74 72 64 61 61 55 54 54 48 48 48 47 45 45 43 40 40 38 38 37 31 31 30 30 29 27 24 22 22 22 21 19 18 16 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 14 14 12 12 12 12 12 12 12 12 11 10 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 8 7 7 6 6 6 6 6 6 6 6 5 4 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 MscI TGG'CCA Cuts at: 631 9882 11095 631 Size: 9251 1213 1877 Fragments arranged by size: 9251 1877 1213 MseI T'TA_A Cuts at: 214 274 444 496 638 977 1227 1656 1668 Size: 60 170 52 142 339 250 429 12 Cuts at: 1668 1708 1740 2220 2276 2289 2522 2583 2664 Size: 40 32 480 56 13 233 61 81 Cuts at: 2664 2680 2718 3048 3129 3145 3173 3598 4035 Size: 16 38 330 81 16 28 425 437 Cuts at: 4035 4330 6250 6302 6307 6321 6374 6609 6648 Size: 295 1920 52 5 14 53 235 39 Cuts at: 6648 7013 7385 9302 9585 9807 10047 11139 11267 Size: 365 372 1917 283 222 240 1092 128 Cuts at: 11267 11381 11876 214 Size: 114 495 679 Fragments arranged by size: 1920 1917 1092 679 495 480 437 429 425 372 365 339 330 295 283 250 240 235 233 222 170 142 128 114 81 81 61 60 56 53 52 52 40 39 38 32 28 16 16 14 13 12 5 MslI CAynn'nnrTG Cuts at: 1179 1181 1774 2194 3323 5170 6689 6848 7207 Size: 2 593 420 1129 1847 1519 159 359 Cuts at: 7207 8049 9935 11124 1179 Size: 842 1886 1189 2396 Fragments arranged by size: 2396 1886 1847 1519 1189 1129 842 593 420 359 159 2 MspI C'CG_G Cuts at: 12 78 112 168 410 419 771 899 941 Size: 66 34 56 242 9 352 128 42 Cuts at: 941 3240 3492 3507 3517 3607 3686 3790 3835 Size: 2299 252 15 10 90 79 104 45 Cuts at: 3835 3879 3954 4138 4185 4353 4481 4510 4586 Size: 44 75 184 47 168 128 29 76 Cuts at: 4586 4977 5011 5159 5397 5423 5751 5898 5924 Size: 391 34 148 238 26 328 147 26 Cuts at: 5924 6114 6518 6552 6619 6729 6971 7655 7926 Size: 190 404 34 67 110 242 684 271 Cuts at: 7926 8018 8059 8833 8857 8881 8908 9021 9140 Size: 92 41 774 24 24 27 113 119 Cuts at: 9140 9199 9363 9489 10210 10536 10932 11848 12332 Size: 59 164 126 721 326 396 916 484 Cuts at: 12332 12 Size: 21 Fragments arranged by size: 2299 916 774 721 684 484 404 396 391 352 328 326 271 252 242 242 238 190 184 168 164 148 147 128 128 126 119 113 110 104 92 90 79 76 75 67 66 59 56 47 45 44 42 41 34 34 34 29 27 26 26 24 24 21 15 10 9 MspA1I CmG'CkG Cuts at: 48 554 998 1153 1505 3848 4314 4550 4923 Size: 506 444 155 352 2343 466 236 373 Cuts at: 4923 5043 5280 5886 6131 7072 7644 9704 11177 Size: 120 237 606 245 941 572 2060 1473 Cuts at: 11177 48 Size: 1212 Fragments arranged by size: 2343 2060 1473 1212 941 606 572 506 466 444 373 352 245 237 236 155 120 MunI C'AATT_G Cuts at: 262 1607 2532 9923 262 Size: 1345 925 7391 2680 Fragments arranged by size: 7391 2680 1345 925 MwoI GCnn_nnn'nnGC Cuts at: 419 560 1123 1578 2871 3250 3581 3583 3678 Size: 141 563 455 1293 379 331 2 95 Cuts at: 3678 3687 3696 3756 3883 4008 4014 4134 4143 Size: 9 9 60 127 125 6 120 9 Cuts at: 4143 4147 4225 4234 4238 4243 4320 4356 4506 Size: 4 78 9 4 5 77 36 150 Cuts at: 4506 4522 4528 4531 4665 4671 4751 4802 4857 Size: 16 6 3 134 6 80 51 55 Cuts at: 4857 5181 5185 5190 5199 5299 5308 5557 5597 Size: 324 4 5 9 100 9 249 40 Cuts at: 5597 6169 6557 6677 7507 7621 7929 8091 8138 Size: 572 388 120 830 114 308 162 47 Cuts at: 8138 8153 8198 8207 8216 8261 8270 8315 8342 Size: 15 45 9 9 45 9 45 27 Cuts at: 8342 8351 8396 8423 8432 8465 8474 8483 8498 Size: 9 45 27 9 33 9 9 15 Cuts at: 8498 8525 8534 8549 8564 8579 8594 8603 8618 Size: 27 9 15 15 15 15 9 15 Cuts at: 8618 8627 8642 8651 8678 8705 8720 8729 8744 Size: 9 15 9 27 27 15 9 15 Cuts at: 8744 8753 8768 8777 8810 8853 9133 9314 10132 Size: 9 15 9 33 43 280 181 818 Cuts at: 10132 10783 10792 10886 11122 11943 12088 12215 419 Size: 651 9 94 236 821 145 127 545 Fragments arranged by size: 1293 830 821 818 651 572 563 545 455 388 379 331 324 308 280 249 236 181 162 150 145 141 134 127 127 125 120 120 114 100 95 94 80 78 77 60 55 51 47 45 45 45 45 43 40 36 33 33 27 27 27 27 27 16 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 6 6 6 5 5 4 4 4 3 2 NarI GG'CG_CC Cuts at: 1510 5345 1510 Size: 3835 8506 NciI CC's_GG Cuts at: 78 113 3240 3241 3687 3791 3879 3955 4186 Size: 35 3127 1 446 104 88 76 231 Cuts at: 4186 4482 4587 4977 5012 5398 5924 6620 6971 Size: 296 105 390 35 386 526 696 351 Cuts at: 6971 7656 8018 8019 8834 8858 8882 8909 9022 Size: 685 362 1 815 24 24 27 113 Cuts at: 9022 9140 9141 9199 9200 9489 10210 10536 10932 Size: 118 1 58 1 289 721 326 396 Cuts at: 10932 10933 11848 11849 78 Size: 1 915 1 570 Fragments arranged by size: 3127 915 815 721 696 685 570 526 446 396 390 386 362 351 326 296 289 231 118 113 105 104 88 76 58 35 35 27 24 24 1 1 1 1 1 1 NcoI C'CATG_G Cuts at: 593 4705 7963 10772 11365 593 Size: 4112 3258 2809 593 1569 Fragments arranged by size: 4112 3258 2809 1569 593 NdeI CA'TA_TG Cuts at: 10131 10171 10201 10261 10351 10411 10441 10527 10587 Size: 40 30 60 90 60 30 86 60 Cuts at: 10587 10677 10737 11782 11803 11857 10131 Size: 90 60 1045 21 54 10615 Fragments arranged by size: 10615 1045 90 90 86 60 60 60 60 54 40 30 30 21 NgoAIV G'CCGG_C Cuts at: 418 4137 4352 5422 418 Size: 3719 215 1070 7337 Fragments arranged by size: 7337 3719 1070 215 NheI G'CTAG_C Cuts at: 1139 1139 Size: 12341 NlaIII _CATG' Cuts at: 20 125 402 515 536 597 827 1278 1344 Size: 105 277 113 21 61 230 451 66 Cuts at: 1344 1375 1397 1606 1629 1773 2400 2902 3282 Size: 31 22 209 23 144 627 502 380 Cuts at: 3282 3484 4583 4709 4800 4855 4970 5075 5193 Size: 202 1099 126 91 55 115 105 118 Cuts at: 5193 5321 5336 5393 6268 6759 6769 6847 6883 Size: 128 15 57 875 491 10 78 36 Cuts at: 6883 7276 7381 7440 7741 7852 7967 9538 9860 Size: 393 105 59 301 111 115 1571 322 Cuts at: 9860 9919 9940 10024 10080 10192 10776 11232 11369 Size: 59 21 84 56 112 584 456 137 Cuts at: 11369 11702 11726 12007 12199 12251 20 Size: 333 24 281 192 52 110 Fragments arranged by size: 1571 1099 875 627 584 502 491 456 451 393 380 333 322 301 281 277 230 209 202 192 144 137 128 126 118 115 115 113 112 111 110 105 105 105 91 84 78 66 61 59 59 57 56 55 52 36 31 24 23 22 21 21 15 10 NlaIV GGn'nCC Cuts at: 408 430 1158 1511 1834 1989 2029 2116 3224 Size: 22 728 353 323 155 40 87 1108 Cuts at: 3224 3490 3958 4175 4826 4881 5346 5395 5430 Size: 266 468 217 651 55 465 49 35 Cuts at: 5430 5465 5576 5615 6387 6481 6522 6733 7323 Size: 35 111 39 772 94 41 211 590 Cuts at: 7323 7548 7549 7863 7924 8014 8101 8102 9041 Size: 225 1 314 61 90 87 1 939 Cuts at: 9041 9159 9160 9196 9268 9480 9487 10938 11116 Size: 118 1 36 72 212 7 1451 178 Cuts at: 11116 11117 11131 11248 11754 11886 11922 11947 11990 Size: 1 14 117 506 132 36 25 43 Cuts at: 11990 11991 12181 12209 408 Size: 1 190 28 540 Fragments arranged by size: 1451 1108 939 772 728 651 590 540 506 468 465 353 323 314 266 225 217 212 211 190 178 155 132 118 117 111 94 90 87 87 72 61 55 49 43 41 40 39 36 36 35 35 28 25 22 14 7 1 1 1 1 1 NotI GC'GGCC_GC Cuts at: 1134 1134 Size: 12341 NruI TCG'CGA Cuts at: 1564 1564 Size: 12341 NsiI A_TGCA'T Cuts at: 4798 4853 10190 4798 Size: 55 5337 6949 Fragments arranged by size: 6949 5337 55 NspI r_CATG'y Cuts at: 125 1344 1375 1629 4800 4855 4970 10024 10080 Size: 1219 31 254 3171 55 115 5054 56 Cuts at: 10080 12007 12199 12251 125 Size: 1927 192 52 215 Fragments arranged by size: 5054 3171 1927 1219 254 215 192 115 56 55 52 31 Pfl1108I TCGTAG Cuts at: 6455 6455 Size: 12341 PflMI CCAn_nnn'nTGG Cuts at: 669 3090 4117 5460 5509 9191 9500 11366 669 Size: 2421 1027 1343 49 3682 309 1866 1644 Fragments arranged by size: 3682 2421 1866 1644 1343 1027 309 49 PleI GAGTCnnnn'n_ Cuts at: 13 1470 2896 2993 3981 5923 6426 7787 9003 Size: 1457 1426 97 988 1942 503 1361 1216 Cuts at: 9003 9330 9465 9523 11179 13 Size: 327 135 58 1656 1175 Fragments arranged by size: 1942 1656 1457 1426 1361 1216 1175 988 503 327 135 97 58 Psp5II rG'GwC_Cy Cuts at: 7547 7874 8100 9589 11752 7547 Size: 327 226 1489 2163 8136 Fragments arranged by size: 8136 2163 1489 327 226 Psp1406I AA'CG_TT Cuts at: 809 4291 6663 7036 809 Size: 3482 2372 373 6114 Fragments arranged by size: 6114 3482 2372 373 PstI C_TGCA'G Cuts at: 1623 1849 6682 1623 Size: 226 4833 7282 Fragments arranged by size: 7282 4833 226 PvuI CG_AT'CG Cuts at: 1314 6807 1314 Size: 5493 6848 PvuII CAG'CTG Cuts at: 998 1153 4550 4923 998 Size: 155 3397 373 8416 Fragments arranged by size: 8416 3397 373 155 RcaI T'CATG_A Cuts at: 1769 6264 7272 7377 1769 Size: 4495 1008 105 6733 Fragments arranged by size: 6733 4495 1008 105 RleAI CCCACAnnnnnnnnn_nnn' Cuts at: 1680 2152 2560 9510 10943 11036 1680 Size: 472 408 6950 1433 93 2985 Fragments arranged by size: 6950 2985 1433 472 408 93 RsaI GT'AC Cuts at: 481 1019 1158 1317 1490 1558 2695 3866 3983 Size: 538 139 159 173 68 1137 1171 117 Cuts at: 3983 6917 7870 12002 12226 12286 481 Size: 2934 953 4132 224 60 536 Fragments arranged by size: 4132 2934 1171 1137 953 538 536 224 173 159 139 117 68 60 SacI G_AGCT'C Cuts at: 9310 9310 Size: 12341 SacII CC_GC'GG Cuts at: 9705 9705 Size: 12341 SalI G'TCGA_C Cuts at: 7 1613 7 Size: 1606 10735 SapI GCTCTTCn'nnn_ Cuts at: 4161 4161 Size: 12341 Sau96I G'GnC_C Cuts at: 1552 1870 2114 2115 3609 3679 3792 3876 3957 Size: 318 244 1 1494 70 113 84 81 Cuts at: 3957 4583 5275 5399 6479 6558 6575 6797 7413 Size: 626 692 124 1080 79 17 222 616 Cuts at: 7413 7547 7862 7874 7913 7937 8036 8100 8988 Size: 134 315 12 39 24 99 64 888 Cuts at: 8988 9039 9113 9157 9158 9182 9194 9478 9485 Size: 51 74 44 1 24 12 284 7 Cuts at: 9485 9491 9503 9589 10820 10902 11114 11115 11246 Size: 6 12 86 1231 82 212 1 131 Cuts at: 11246 11752 11885 11921 11945 11988 11989 12179 12207 Size: 506 133 36 24 43 1 190 28 Cuts at: 12207 12208 1552 Size: 1 1685 Fragments arranged by size: 1685 1494 1231 1080 888 692 626 616 506 318 315 284 244 222 212 190 134 133 131 124 113 99 86 84 82 81 79 74 70 64 51 44 43 39 36 28 24 24 24 17 12 12 12 7 6 1 1 1 1 1 Sau3AI 'GATC_ Cuts at: 170 406 1311 1633 1993 2389 2625 3235 3775 Size: 236 905 322 360 396 236 610 540 Cuts at: 3775 3856 4363 4589 5107 5236 5267 5282 6110 Size: 81 507 226 518 129 31 15 828 Cuts at: 6110 6185 6196 6204 6282 6294 6399 6740 6758 Size: 75 11 8 78 12 105 341 18 Cuts at: 6758 6804 7062 7079 7115 7465 7719 7829 8030 Size: 46 258 17 36 350 254 110 201 Cuts at: 8030 10875 11638 170 Size: 2845 763 873 Fragments arranged by size: 2845 905 873 828 763 610 540 518 507 396 360 350 341 322 258 254 236 236 226 201 129 110 105 81 78 75 46 36 31 18 17 15 12 11 8 ScaI AGT'ACT Cuts at: 481 3866 6917 481 Size: 3385 3051 5905 Fragments arranged by size: 5905 3385 3051 ScrFI CC'n_GG Cuts at: 78 113 664 720 1130 2385 3240 3241 3687 Size: 35 551 56 410 1255 855 1 446 Cuts at: 3687 3782 3791 3806 3879 3955 4186 4243 4482 Size: 95 9 15 73 76 231 57 239 Cuts at: 4482 4587 4829 4884 4977 5012 5199 5398 5572 Size: 105 242 55 93 35 187 199 174 Cuts at: 5572 5693 5706 5924 6620 6971 7605 7656 7717 Size: 121 13 218 696 351 634 51 61 Cuts at: 7717 7866 7878 8010 8018 8019 8834 8858 8882 Size: 149 12 132 8 1 815 24 24 Cuts at: 8882 8909 8932 8956 8992 9022 9048 9140 9141 Size: 27 23 24 36 30 26 92 1 Cuts at: 9141 9174 9199 9200 9314 9483 9489 9501 9673 Size: 33 25 1 114 169 6 12 172 Cuts at: 9673 10005 10038 10210 10536 10932 10933 11255 11848 Size: 332 33 172 326 396 1 322 593 Cuts at: 11848 11849 11986 11994 12095 78 Size: 1 137 8 101 324 Fragments arranged by size: 1255 855 815 696 634 593 551 446 410 396 351 332 326 324 322 242 239 231 218 199 187 174 172 172 169 149 137 132 121 114 105 101 95 93 92 76 73 61 57 56 55 51 36 35 35 33 33 30 27 26 25 24 24 24 23 15 13 12 12 9 8 8 6 1 1 1 1 1 1 SexAI A'CCwGG_T Cuts at: 10003 10003 Size: 12341 SfaNI GCATCnnnnn'nnnn_ Cuts at: 90 328 566 1051 2466 3359 3570 3768 4130 Size: 238 238 485 1415 893 211 198 362 Cuts at: 4130 4159 4443 4783 4838 4997 5162 5174 5641 Size: 29 284 340 55 159 165 12 467 Cuts at: 5641 6693 6884 7133 7519 9259 9568 12297 90 Size: 1052 191 249 386 1740 309 2729 134 Fragments arranged by size: 2729 1740 1415 1052 893 485 467 386 362 340 309 284 249 238 238 211 198 191 165 159 134 55 29 12 SfcI C'TryA_G Cuts at: 1619 1845 1865 1909 3181 4261 4545 5809 6000 Size: 226 20 44 1272 1080 284 1264 191 Cuts at: 6000 6678 9072 12152 1619 Size: 678 2394 3080 1808 Fragments arranged by size: 3080 2394 1808 1272 1264 1080 678 284 226 191 44 20 SfiI GGCCn_nnn'nGGCC Cuts at: 419 4665 419 Size: 4246 8095 SgrAI Cr'CCGG_yG Cuts at: 3506 4137 4352 9362 3506 Size: 631 215 5010 6485 Fragments arranged by size: 6485 5010 631 215 SmaI CCC'GGG Cuts at: 3241 8019 9141 9200 10933 11849 3241 Size: 4778 1122 59 1733 916 3733 Fragments arranged by size: 4778 3733 1733 1122 916 59 SpeI A'CTAG_T Cuts at: 11411 11411 Size: 12341 SphI G_CATG'C Cuts at: 1344 1629 4800 4855 10080 1344 Size: 285 3171 55 5225 3605 Fragments arranged by size: 5225 3605 3171 285 55 Sse8387I CC_TGCA'GG Cuts at: 1623 1623 Size: 12341 SspI AAT'ATT Cuts at: 586 1682 2655 2808 4300 7241 586 Size: 1096 973 153 1492 2941 5686 Fragments arranged by size: 5686 2941 1492 1096 973 153 StuI AGG'CCT Cuts at: 4616 7603 4616 Size: 2987 9354 StyI C'CwwG_G Cuts at: 423 593 2935 3438 4611 4705 5508 7888 7963 Size: 170 2342 503 1173 94 803 2380 75 Cuts at: 7963 10114 10772 11365 11426 423 Size: 2151 658 593 61 1338 Fragments arranged by size: 2380 2342 2151 1338 1173 803 658 593 503 170 94 75 61 SwaI ATTT'AAAT Cuts at: 1657 1657 Size: 12341 TaqI T'CG_A Cuts at: 8 1214 1614 3394 3891 3906 5266 5407 5644 Size: 1206 400 1780 497 15 1360 141 237 Cuts at: 5644 7088 7456 8839 8863 8887 11526 11774 8 Size: 1444 368 1383 24 24 2639 248 575 Fragments arranged by size: 2639 1780 1444 1383 1360 1206 575 497 400 368 248 237 141 24 24 15 TaqII GACCGAnnnnnnnnn_nn' Cuts at: 676 4214 6785 6970 7123 7140 7497 676 Size: 3538 2571 185 153 17 357 5520 Fragments arranged by size: 5520 3538 2571 357 185 153 17 TfiI G'AwT_C Cuts at: 545 1596 3094 3118 3513 3786 5145 5443 7555 Size: 1051 1498 24 395 273 1359 298 2112 Cuts at: 7555 7845 11610 11687 545 Size: 290 3765 77 1199 Fragments arranged by size: 3765 2112 1498 1359 1199 1051 395 298 290 273 77 24 ThaI CG'CG Cuts at: 54 157 159 1487 1542 1564 3305 3575 3577 Size: 103 2 1328 55 22 1741 270 2 Cuts at: 3577 3586 3699 3701 3703 3900 4023 4135 4219 Size: 9 113 2 2 197 123 112 84 Cuts at: 4219 4281 4348 4350 4382 4445 4447 4516 4931 Size: 62 67 2 32 63 2 69 415 Cuts at: 4931 4933 5037 5118 5179 5245 5374 5384 5529 Size: 2 104 81 61 66 129 10 145 Cuts at: 5529 5555 5591 6172 6502 6995 7327 9034 9704 Size: 26 36 581 330 493 332 1707 670 Cuts at: 9704 9961 9978 10889 11059 54 Size: 257 17 911 170 1336 Fragments arranged by size: 1741 1707 1336 1328 911 670 581 493 415 332 330 270 257 197 170 145 129 123 113 112 104 103 84 81 69 67 66 63 62 61 55 36 32 26 22 17 10 9 2 2 2 2 2 2 2 TseI GCwGC Cuts at: 22 119 165 289 1570 1845 2318 2508 2839 Size: 97 46 124 1281 275 473 190 331 Cuts at: 2839 3993 4312 4523 4532 4924 4971 5068 5546 Size: 1154 319 211 9 392 47 97 478 Cuts at: 5546 5561 5887 5952 5955 6161 6489 6678 6855 Size: 15 326 65 3 206 328 189 177 Cuts at: 6855 7660 8092 9643 9699 10096 10881 11178 22 Size: 805 432 1551 56 397 785 297 1185 Fragments arranged by size: 1551 1281 1185 1154 805 785 478 473 432 397 392 331 328 326 319 297 275 211 206 190 189 177 124 97 97 65 56 47 46 15 9 3 Tsp45I 'GTsAC_ Cuts at: 101 2279 3203 3311 3653 4376 4391 4438 4985 Size: 2178 924 108 342 723 15 47 547 Cuts at: 4985 5080 5286 6693 6904 7522 9323 9631 9893 Size: 95 206 1407 211 618 1801 308 262 Cuts at: 9893 9942 9947 11506 11658 11713 12191 101 Size: 49 5 1559 152 55 478 251 Fragments arranged by size: 2178 1801 1559 1407 924 723 618 547 478 342 308 262 251 211 206 152 108 95 55 49 47 15 5 Tsp509I 'AATT_ Cuts at: 262 326 450 489 894 1234 1253 1607 1639 Size: 64 124 39 405 340 19 354 32 Cuts at: 1639 1652 1805 2223 2262 2286 2468 2532 2677 Size: 13 153 418 39 24 182 64 145 Cuts at: 2677 2699 2818 2918 3112 3149 3197 3964 4331 Size: 22 119 100 194 37 48 767 367 Cuts at: 4331 4409 4694 4786 4841 5458 5472 6304 6610 Size: 78 285 92 55 617 14 832 306 Cuts at: 6610 6865 7430 7594 7667 7705 9278 9923 10049 Size: 255 565 164 73 38 1573 645 126 Cuts at: 10049 10102 10308 10484 10634 10862 11075 11140 11319 Size: 53 206 176 150 228 213 65 179 Cuts at: 11319 11489 11770 11813 262 Size: 170 281 43 790 Fragments arranged by size: 1573 832 790 767 645 617 565 418 405 367 354 340 306 285 281 255 228 213 206 194 182 179 176 170 164 153 150 145 126 124 119 100 92 78 73 65 64 64 55 53 48 43 39 39 38 37 32 24 22 19 14 13 Tth111I GACn'n_nGTC Cuts at: 5078 5078 Size: 12341 Tth111II CAArCAnnnnnnnnn_nn' Cuts at: 2887 3124 3271 6134 6141 6173 7429 9202 10108 Size: 237 147 2863 7 32 1256 1773 906 Cuts at: 10108 10825 12164 2887 Size: 717 1339 3064 Fragments arranged by size: 3064 2863 1773 1339 1256 906 717 237 147 32 7 UbaJI GCsGC Cuts at: 555 1134 1137 3346 3349 3704 3846 3898 4009 Size: 579 3 2209 3 355 142 52 111 Cuts at: 4009 4026 4066 4094 4097 4182 4357 4360 4666 Size: 17 40 28 3 85 175 3 306 Cuts at: 4666 5163 5246 5303 5348 5427 5549 5556 5589 Size: 497 83 57 45 79 122 7 33 Cuts at: 5589 5744 6828 6950 7179 7478 7930 8023 8905 Size: 155 1084 122 229 299 452 93 882 Cuts at: 8905 9702 10127 11041 12336 555 Size: 797 425 914 1295 560 Fragments arranged by size: 2209 1295 1084 914 882 797 579 560 497 452 425 355 306 299 229 175 155 142 122 122 111 93 85 83 79 57 52 45 40 33 28 17 7 3 3 3 3 VspI AT'TA_AT Cuts at: 2718 6609 2718 Size: 3891 8450 XbaI T'CTAG_A Cuts at: 1 1 Size: 12341 XcmI CCAnnnn_n'nnnnTGG Cuts at: 1980 3359 9107 10158 1980 Size: 1379 5748 1051 4163 Fragments arranged by size: 5748 4163 1379 1051 XmnI GAAnn'nnTTC Cuts at: 7036 7036 Size: 12341 Enzymes that do cut: AatII AccI AceIII AciI AflIII AgeI AluI AlwI Alw21I Alw44I AlwNI ApaI ApaBI ApoI AvaI AvaII AvrII BaeI BamHI BanI BanII BbsI BbvI BccI Bce83I BcefI BcgI BfaI BglI BglII BmgI BpmI Bpu10I Bpu1102I BsaI BsaAI BsaBI BsaHI BsaJI BsaWI BsaXI BsbI BscGI BseRI BsgI BsiI BsiEI BslI BsmI BsmAI BsmBI BsmFI BsoFI Bsp24I Bsp1286I BspEI BspGI BspLU11I BspMI BsrI BsrBI BsrDI BsrFI BssHII BstEII BstXI BstYI Bsu36I Cac8I CjeI CjePI ClaI CviJI CviRI DdeI DpnI DraI DraIII DrdI DrdII DsaI EaeI EagI Eam1105I EarI EciI Eco47III Eco57I EcoNI EcoO109I EcoRI EcoRII EcoRV FauI FokI FspI GdiII HaeI HaeII HaeIII HgaI HgiEII HhaI Hin4I HincII HindIII HinfI HpaI HphI KpnI MaeII MaeIII MboII MluI MmeI MnlI MscI MseI MslI MspI MspA1I MunI MwoI NarI NciI NcoI NdeI NgoAIV NheI NlaIII NlaIV NotI NruI NsiI NspI Pfl1108I PflMI PleI Psp5II Psp1406I PstI PvuI PvuII RcaI RleAI RsaI SacI SacII SalI SapI Sau96I Sau3AI ScaI ScrFI SexAI SfaNI SfcI SfiI SgrAI SmaI SpeI SphI Sse8387I SspI StuI StyI SwaI TaqI TaqII TfiI ThaI TseI Tsp45I Tsp509I Tth111I Tth111II UbaJI VspI XbaI XcmI XmnI Enzymes that do not cut: AflII AscI BclI BsrGI Bst1107I FseI NspV PacI PmeI PmlI PshAI RsrII SgfI SnaBI SrfI SunI XhoI